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在六千五百多万年前，白垩纪末期的某一天，地球上存在着各种各样的巨型生物，而占主导地位的是恐龙，这时以原始状态存在的地球生态，完全处于一个独立的物种年代。
突然宇宙中太阳系内，凭空出现了空间的波动，从亚宇宙空间中一艘约两公里方圆的宇宙飞舟穿出了空间，在空间力量的推动下撞向了正前方的地球。
很快在地球的天空中，出现了一道剌眼的白光，如同一颗小行星，这艘宇宙飞舟以每秒40公里的速度一头撞进地球的某一处海洋，在海底撞出了一个巨大的深坑，同时宇宙飞舟开始自爆，显然这次撞击引起了宇宙飞舟内部的毁损，然而由于宇宙飞舟材质的坚固，虽然自爆使得宇宙飞舟多处破裂，但总算没有完全毁损。
于此同时，原本在地球上一块陆地，约有地球近五十分之一的陆地，从地壳中被撞裂，脱离了出去，在地球的自转作用下，甩出了地球，在大气层的摩擦燃烧下，化成了一个圆形的行星，从此成为了地球一个近邻，月球。
而在地球上，发生了一场非常可怕的灾难，在宇宙飞舟撞击下，地壳发生了巨变，失去脱离了化成月球的这块陆地，四周的陆地向脱离处挤压而来，把宇宙飞舟埋在了地球内部。
整个世界的地貌发生了沧海桑田的变化，同时也使得地壳和地核产生了脱离，地壳变成了漂移的地壳。
撞击引起海水被迅速气化，蒸气向高空喷射达数万米，随即掀起的海啸高达5公里，并以极快的速度扩散，冲天大水横扫着陆地上的一切，汹涌的巨浪席卷地球表面后会合于撞击点的背面一端，在那里巨大的海水力量引发了强烈的火山喷发，同时使地球板块的运动方向再次发生了改变。
这次撞击，使得地球产生了铺天盖地灰尘，极地雪融化，植物毁灭了，火山灰也充满天空。
一时间暗无天日，气温骤降，大雨滂沱，山洪暴发，泥石流将许多生物卷走并埋葬起来。
在以后的数月乃至数年里，天空依然尘烟翻滚，乌云密布，地球因终年不见阳光而进入低温中，苍茫大地一时间沉寂无声，生物史上的一个时代就这样结束了。
然而更严重的一个问题是，由于宇宙飞舟的撞入，月球的脱离，地球原本的大气层被破坏了，产生了一个联通宇宙的大洞，宇宙射线随着地球的自转，引起了地球上残存的生物发生了变异，各自各样神话传说中的生物诞生了。
时间便这样过了千百多年，地球上依旧没能恢复原本的模样，只是受到宇宙射线刺激产生的变异的生物越来越多，这些生物有些在神话中流传了下来，有些直接被历史所淡忘，这些生物被后来的人类称为神兽、妖兽、魔兽等等之类。
这样千百年后的某一日，从原本埋葬了宇宙飞舟的海洋，如今已经成为了一处高原大陆，这大陆中的某一处平原忽然震动了起来，引起了周围山脉、地形的龟裂，一个如同蚯蚓状的巨大钢铁怪物钻了出来。
这就是当年降临地球，使得地球上一个时代的生物几乎灭亡，使得至今人类所知晓的恐龙灭绝，同时也使得地球开创了一个新时代的祸首，那艘来自太空的宇宙飞舟改装物。
此时的宇宙飞舟中已经没有活物存在，只有宇宙飞舟的智能系统主脑通过千百多年的时间，改造了宇宙飞舟，成为了现在这么一个像蚯蚓的奇怪陆地爬行舟。
这个陆地爬行舟依旧沿用了原本宇宙飞舟的名号，那就是在神话传说中，开天辟地的“盘古”，这艘宇宙飞舟是来自遥远外太空某一处星系的“盘古”号飞舟。
而这个宇宙飞舟的智能操控主脑则被原本的外星人控制者称为女娲，多么熟悉的两个名字盘古、女娲，传说中开天辟地，造化万物生灵的神话始祖。
盘古号从地下爬出地表后，女娲智能系统便开始了对地球的环境以及相关原始土著生物的探测工作，从盘古号飞出了许多无人的探测飞船，对地球做着各种数据采集。
然而大多数探测飞船都被地球上变异的强悍生物直接破坏，只有少数飞船回到了盘古号，但也使得女娲智能系统得到了当时地球上的各类信息。
盘古号飞舟原本是来自宇宙某一星系智能生命的殖民探测飞船，在经历了一次意外袭击后，通过亚宇宙穿梭来到了太阳系，此刻飞舟上所有外星智能生命已经在飞舟坠毁地球的时候死去。
只有女娲智能系统这艘宇宙飞舟的控制主脑依旧保持着工作，失去了外星智能生命的指挥，它只好按照飞舟中储存的原始殖民系统程序规定的方式，开展前期的星际殖民准备。
消灭一切被殖民星球对未来殖民统治有威胁的原始土著生物，建筑殖民需要的基础设施，发射宇宙信号源，制作殖民星球的宇宙坐标。
通过对地球现状的探测，女娲智能系统感觉到了任务的艰难，地球上由于宇宙射线的刺激，产生了无数基因变异的强悍生物，最强的有后来被称为中国人先祖的神龙，还有祥兽麒麟，凤凰，当然这些都可以算是顶级的神兽，再次一点的，就是后来西方传说中的西方飞龙，三头蛇（这两种生物可能是从恐龙中变异产生），另外还有比蒙，雷鸟等等之类的变异生物，再次一些的变异生物也不少，当然，在当时这些生物也只是产生变异不久，实力还没有达到后期的强悍，但相对而言，也足以危险到女娲智能系统原本所属外星星球的殖民者。
根据女娲智能系统的计算，它制定了一个殖民计划安排，首先它需要重新修补盘古号，盘古号由于坠毁撞击，遭受了重大破损，为了从地底爬出来，女娲只是操作飞舟机器人简单的修补了一下，这才变成了如今的蚯蚓模样，但盘古号的能量驱动核心在坠落中遭到破坏，无法作宇宙飞行了，大修一番，最多只能恢复低空飞行功能。
其次它准备修补地球大气层，经过了千百多年的时间，地球自身已经使得那个大气层空洞缩小了不少，但还有五公里方圆，这里说的大气层空洞自然不是说一个联通宇宙的空气洞，而是一处无法抵御宇宙射线的稀薄大气层。
第三，它将通过殖民星系的克隆技术，制造出强大的克隆战士，剿杀地球中的那些变异生物，从而制造一个安全的殖民环境。
之后，前面两个工作花了近三千年的时间才真正完成，仅仅盘古号修复工作就花了一千多年，地球上到处是变异的生物，女娲智能系统很难取得合适的矿物来修补盘古号，为此盘古号不得不以本体面对各类变异生物，这一经历，可以说是充满的危险性，最终恢复了盘古号的大部分功能，并可以在地球内悬浮飞行。
之后，通过两千多年的努力，才又通过矿物燃烧方法修补大气层，终于使得地球的大气层空洞完全恢复。
在这期间，女娲智能系统根据盘古号和地球变异生物战斗后获得的变异生物的基因资料，开始了它第三步克隆战士的制造计划。
在盘古号宇宙飞舟中原本存储有许多专门制造高等克隆战士的外星克隆原液，这种克隆原液培养出来的克隆战士，可以完美的融合各种克隆基因，通过这种外星克隆原液制造出来的克隆战士，被女娲智能系统称为巫战士。
然而由于当初宇宙飞舟的毁损，这些克隆原液也泄漏了绝大部分，女娲智能系统使用盘古号飞舟中残存的克隆原液，只制造出了十二个祖巫，这些祖巫的基因融合了地球上各种变异生物的优质基因，身体素质以及力量甚至可以比拟地球上那些变异的神兽，几个祖巫联合，就是神兽也不是他们的对手。
然而，女娲还是错误的估计了地球上这些变异生物的实力，毕竟智能系统无法考虑到意外的变化，三千年的时间，地球上原生土著变异生物也产生了进化。
地球上的变异生物中出现了智能，特别是那些神兽级别的生物，它们已经不在是只有生存本能的动物，而变成了“妖”兽，所谓的“妖”，就是变异，不同一般，懂得思考的。
这些妖兽的本领比原本的普通变异生物更为强大，它们炼就了内丹，可以变化成半兽半人的战斗形象，它们通过内丹感应到天地自然的能量，借用这些能量，战斗起来即便是十二祖巫也不能轻易战胜。