秦焰的新军制，实行的是颇为简单有效的一种战时军制。其实这种军队制度，秦焰是根据前世时一款战略游戏中得出的灵感，此时却正好用上。
秦焰的军制中，以五十人为一队，设队长，这是最基本的编制。之后，两队为一连，设连长。五连（即五百人）为一营，设营长。十营为一旅，设旅长。两旅为一军，设将军。其中营长以下，由所属单位中所有战士推举或选拔担任，营长以上，则有秦焰亲自拔擢。
五万五千人，被分成了五军一旅，五军分别由李广衡、纪擎天、纪倾城、苏府苏郢、韦府韦慕、五人统领。当然，纪倾城身边，秦焰还安排了林洛儿帮助。
还有一支直辖旅，则有秦焰亲自统帅，秦焰相信，这支直辖部队，在将来的战场上绝对会成为一支活跃的精兵。
在划分的时候，秦焰也有所考量，尽量使得原来的小集团分开编队，否则的话，这些小集团在新的战斗序列中很容易又形成小集体，这对于全军的凝聚力极为不易。
由于工程庞大，秦焰不得不从各处借调了一百多名政治人才，经过这些人整整三天的排列，初步的战斗序列才算是颇具雏形。秦焰以“风、林、火、山、雷”来为五军命名，同时也是确定了五支部队的战斗方针和部队性质。
风军由大将李广衡率领，孙子兵法云：“疾如风！”故而，这支军队是作为秦焰的耳目和游击兵团存在，在这支军队中，秦焰将全军除了墨军之外的骑兵共八千人都分配了过去，另外还分配了两千重弩兵用以射杀地方战场的枪兵，以掩护骑兵部队。
一切的情报收集、斥候探报、长途奔袭，游击袭扰任务，皆有这支的军队担任。李广衡向秦焰请教战术之时，秦焰曾说了这样一句话：“伤敌于千里之外，索命于须臾之间。”
林军统帅由心思缜密的纪倾城担任，并由林洛儿为副将，孙子兵法云“徐如林。”故而，这支军队是作为主力兵团之一存在的。徐如林原意是指军队步调一致，行动统一，军阵像树林一样严整。但是秦焰应用在这支军队中，意思就变成了：“诸兵种配合的完美阵法作战！”
在这支军队中，秦焰配置了两千弓箭手，三千长戟兵，三千重步兵，两千战车兵，只要阵法得当，诸兵种配合之间，演绎出的战阵足以将任何数量均等之敌绞杀其中。
林军平时以秦焰直辖旅座椅护卫的身份存在的（当然秦焰如此安排多少有些暧昧色彩），而在平原战场上，林军将会是主要的战力。
火军由性如烈火的老将军纪擎天担任，老爷子一身的武艺已经站在了四级顶峰，甚至可以说是半只脚进入了五级，所以在武勇上自然不用质疑。至于兵法，当了几十年家臣的纪擎天，又岂会弱于旁人？孙子兵法云：“侵掠如火！”这支部队，秦焰配置了大量长刀兵、斧钺兵、链锤兵等杀伤力巨大的兵种，稍嫌不足的就是防御力和远程打击能力略有欠缺。
火军的主要任务是在短兵相接之时冲击敌军，给对方带来毁灭性的打击。当然，箭雨对射的阶段，火军里面只有一千弓箭手，自然也派不上很大用场了。
山军，担任秦焰直辖旅的右翼护卫，由苏氏大夫苏郢统帅，该军队由两千长枪兵，两千重步兵以及三千弓箭手，三千重弩兵组成。孙子兵法云：“不动如山。”仅此一句，足可以体现山军的防御能力。任尔横行霸道，我自岿然不动。
但是秦焰作为攻击部队，防御力过强的部队在战场上的作用反而相对较小，因此秦焰稍加改造，将山军变为了防御力和远程打击能力并重的部队。若是箭雨对射开始，山军绝对是彼时的主力。
最后的雷军由韦氏大夫韦慕率领，孙子兵法云：“动如雷霆”。因此秦焰在雷军中配备了主要的火器和攻城器械，火枪队、火炮车、井栏车、、冲城车、投石车等等应有尽有，这支军队将作为攻击城池的主力。当然，由于其重要性，所以雷军被安排在最中央的位置，连秦焰的直辖旅都要以护卫雷军的姿态行军。
秦焰的直辖旅，则聚集了各部中挑选的精英，包括墨军五百人，神风营枪兵五百人，王家铁军五百人，沈家武卒五百人，精锐弓弩手一千人，精锐重装长刀兵一千人，重装步兵一千人。这些人平时的任务就是保护指挥中枢，但是关键时刻，他们可以发挥的战力，绝对不逊于任何一支万人的军队！
军队全部编制完毕后，秦焰长出了一口气。攻伐南宫，这准备工作就如此的繁重，以后的战争，其困难度也就可想而知了。
就在所有战士就位的第二天，秦焰又进行了一次全军的集合。
这两天秦焰除了编制部队之外，主要的做的事情就是和这些下级战士进行沟通，基本都到了同吃一锅饭的地步。秦焰本人年纪虽轻，但有着六级武士的实力，说话又不拘小节，很快就赢得了这些士兵的好感。
故而这次集合，大部分士兵对秦焰的感情就和上次不一样了，上次秦焰是用威势压住了众人，这次，却是以低姿态博得了众人的好感。
见秦焰走上城头，城下的士兵们有不少都自发起立，向秦焰致敬。
秦焰笑着道：“各位，这两天过得可好啊？”
“好！”经过几天的融合，众士兵也没了刚开始时的不适应。
“好他娘什么好。”秦焰笑骂道，“三天才见一回肉，老子嘴里都快淡出鸟来了。”
秦焰的话立刻引起了士兵们的阵阵笑声，只觉得这位小将军说话颇对胃口。
秦焰笑道：“从今天起，进入正式的训练阶段。每营我都给你们安排了一个教官，具体怎么个练法，他会告诉你们。你们好好练，成绩好的，我让他天天有肉吃，但是哪个敢消极偷懒，连口汤老子都不给他喝！不光这样，老子还得拿鞭子抽他，为什么？懒驴不抽不使劲！”
话音刚落，又是一片笑声。秦焰心中暗笑，你们现在就安逸吧，一会儿有你们哭的。
秦焰神色一肃：“好，下面先来个热身！全军列队，绕着北盟城，三圈，跑步，走！”
此言一出，顿时士兵们齐齐发出了哀叹。北盟城一面城墙就有四里多地，绕三圈差不多也有五十里，这，这他娘的是热身？
秦焰此时却是笑道：“你们可要抓紧时间，过了饭店再回来，可就没饭吃了啊！”说完，秦焰脸色一变，大喝道：“还不跑！”
一句话如同惊雷，这些士兵浑身一震，立刻迈开大步，向前急冲而去！
看着这些士兵冲锋一般的速度，秦焰冷笑道：“哼，按照这种速度，你们要是能完整跑三圈，我就让你们当统帅。”