虽然萧然算的上是手握大权，更控制着对联邦来说一个重要地盘的全部兵力，但在对联邦内部的情报流通这方面，却是远远比不上幕后控制影响着联邦和利冯兹的。天人帮助反抗组织救人的这件事情上，已经让联邦内部有了天人和反抗组织联合的声音，而在利冯兹的推动之下，联邦很快就通过了对中东和非洲这两个联邦掌控能力最小，同样也是反抗组织活跃最多地方的扫荡行动。
而就在联邦计划着扫荡行动的时间里，通过王留美和拉古纳聚集起来的大批弹药，生活物资，药品，甚至是极少量的ms在利冯兹的帮助下送到了反抗组织的手中，这种对反抗组织来说大手笔的帮助，也让反抗组织的重要人员察觉到了自己的新盟友到底有多么的不凡。
这样数量的援助，而且基本对联邦来说都是违禁品的援助竟然能一路畅通无阻的运送到他们的手中，这也变相的说明了这位盟友支持者在联邦之中也具有着相当的能量，而能得到这么一位盟友的帮助，虽然对反抗组织来说绝对是一件很好的事情，但也不得不让他们在对待萧然这位神秘的盟友保持足够的警惕。
而随着这批物资的抵达，萧然的燃烧军团也以小队为单位然后完全打乱，如今在经过了色ed-d世界的众多资深者加入，并且有了小队的加入之后，新人参与者和资深者的数量也差不多相互持平，所以便以老队伍带新队伍的方式作为战力支持也暂时加入到了反抗组织之中。
这样一来哪怕全部的军团人员加起来其实也并没有划分出太多的队伍，只是每个队伍的人数稍多一些罢了，对于区域极大的非洲地区和中东地区来说也做不到完全覆盖，也只能说是给予支持罢了，而且这其中还没有包括骷髅小队的六名机师，奥兹玛，阿尔特，小卢卡，米歇尔，葛兰葛兰和布雷拉。
不过若是真的将资深者和新人完全分开，其实后果也可以想象，新人们基本都是d级机师，面对上有着级机体结果也只能是呵呵了，萧然的目的是让所有的成员在这次的任务中有足够的成长并团结起来，而对新人来说更是希望他们通过这次的任务累计足够的经验成长为级机师，当然不可能真的就把他们置于危险的境地当中。
所以骷髅小队的六名机师就成为了机动部队，同样来到了地球但却只会在某支分队出现危险的时候以最快的度赶到帮他们解除威胁，而已经对这个世界有着足够了解的艾尔埃尔夫，则作为所有分队的总指挥进入到了反抗组织，成为了支援队伍的队长。
克鲁泽通过利冯兹的安排进入到了联邦之中，在联邦总部得到了一份体面的工作开始对联邦的成员进行接触，以他的能力相信很快便能够找到一批同样有着推翻现有政府想法的人聚集在自己的身边，而巴萨克则留守边境号，个人能力的强大和操作能力的优秀，足以让巴萨克在利冯兹的基地里保护好同样不凡的边境号，而积古斯则带着那如同头盔一般的面具被利冯兹安排进入到了之中，格拉汉姆则顶替了萧然阿历克斯的身份正式的加入到了天人，娜洛则回到了萧然的身边。
所有的一切都安排得妥妥当当，天人，联邦反抗组织四方面都在最短的时间安插进了自己的人，对于庞大的联邦和来说，区区两个人并不会受到任何注意和重视，而天人方面对萧然又是完全的信任，只有反抗组织这一方对于萧然给予的极大物资支持和人员支持有感激但也有一定的警惕，大体上却还是保持了基本的信任。
而开始对反抗组织进行全面扫荡的几个小时之前，这件事情才通过王留美传到了反抗组织的那里，很快反抗组织便开始了全灭的撤退，但几个小时的时间又怎么可能真正将一个庞大的组织完全隐藏起来，于是战争开始了。
这支强大武力部队的带领下，同样也有无数的普通联邦ms加入到了这场对反抗组织的扫荡之中，联邦和情报能力不容小觑，更何况还有着利冯兹，王留美在这其中起到的重要作用，反抗组织的基地一个个的被摧毁，哪怕在提前得到了通知的情况下，大多数基地成员也同样遭受到了追击和屠杀，损失可谓是非常的大，哪怕在集合起来也不复原本的力量。
但在几个重要的基地方面，因为有着燃烧军团的成员帮助，倒是给组织成员的撤离提供了足够的时间和战力，更是在撤退的过程中击破了不少和联邦的ms，让这些基地的反抗组织成员安全的逃离。
这一场扫荡足足持续了好几天的时间，一个反抗组织的基地被现，要么是空就开始遵循着痕迹追击，追杀就是一场惨无人道的屠杀，要么是有人的那就是一场战力号不对等的战斗，然后用无人机进行屠杀。
这样规模的扫荡根本无法瞒过这个世界，哪怕联邦在怎么对信息进行管制，但也还是有不少关于扫荡过程的信息泄漏了出去，一时之间也在世界范围内引起了巨大的震荡。
在这次领头的扫荡行动之中，天人也再次出现并加入到了战斗之中，但这并不代表着天人的行动就完全是在帮助反抗组织的撤离，他们更多的是在单方面的阻拦行动，完全不和反抗组织有任何联系，但这样一来也同样给四散在各地的反抗组织成员更多的隐藏和撤离的时间。
萧然也一直关注着地球另一边的军事行动，每一天甚至是每过几个小时都会有不同的人向他这里来那边情况的一切报告，这其中也包括着卡蒂·马妮金和谢盖尔两人，萧然给他们的回复便是尽可能不要伤害那些反抗组织的成员，扫荡结束之后让两人过来和自己碰面。
卡蒂·马妮金和谢盖尔两人虽然身为但对行动却是真的看不上眼，那种对毫无抵抗能力之人的屠杀让他们和他们手下的人也感到真正的厌恶，所以两人率领的分队反倒成为了这次扫荡行动之中的一股清流，除了那些驾驶着ms和各种反抗的人之外，其实并没有制造出更多的杀戮，哪怕是抓到了反抗组织的成员也仅仅只是将他们关押起来变相的保护在自己的羽翼之下。
动作成功达到了萧然的预期目标，让反抗组织实力极大削弱，让自身的恐怖阴影流传世界，在战斗之中让自己军团的成员得到了更多的战斗经验，让刹那在看见那屠杀的一幕幕之后变得更加的成熟。
就在联邦忙碌着扫荡的时候，两个人也出现在了萧然日本军事基地的办公室之中，在萧然无法离开日本的情况下，这两个人抛开了手边的一切工作亲自来到了萧然的这里，一个是以年迈为由离开了联邦全身心投入到天神之中的拉斐尔教授，而另一个则是担任技术部主任但实际上却同样是天人下属机构天神开部门主管的比利·片桐。
两人的到来让萧然心情也相当不错，而两人的到来也并不会引起其他人的怀疑，毕竟当初两人和萧然的关系不错，并且两人曾经和现在都算得上是联邦的重要保护人员，这次过来拜访也纯属正常，但不会有人想到两人前来萧然这里的真正目的可不仅仅只是拜访那么简单。
这两人在进入萧然的办公室之后，带领着两人进来的娜洛就转身离开，而萧然在看见了已经逐渐年迈的拉斐尔教授之后，也是作为一个晚辈一样亲自的将拉斐尔教授搀扶到了巨大办公室里的沙坐下。
而拉斐尔教授在看到萧然的动作或是萧然本身也显得相当的欣慰，顺着萧然搀扶着自己坐下之后，就直接感叹的开口说道：“你回来了就好，四年了，你离开了四年，真没想到世界竟然会变成这个样子。”
比利·片桐也对着萧然笑了笑，喊了一声将军之后也坐到了拉斐尔教授的身边，一人杵着拐杖坐着，一人双手搭在膝盖上坐着，但两人的目光却全都集中在了萧然的身上。
看着拉斐尔教授那对于这个世界局势揪心的眼神，萧然也是微微的叹了口气：“我也没想到在联邦建立之后世界竟然又会变成现在这样成立最开始是为了保证世界的平稳，但没想到只是四年世界，这支部队竟然会变成了这样，导致了那么多的屠杀，战斗，在加上这次对中东和非洲地区的扫荡行动，更是让世界的矛盾再次凸显，完全脱离了之前我们计划。”
说道这里，拉斐尔教授有些生气，用着非常不满的眼神看了萧然一眼重重的将自己的拐杖敲在了地上，气呼呼的说道：“要我说当初你就不应该离开，要不是你离开了那支部队在你的掌握之中又怎么可能会变成今天这样，到现在外星人还没有来，自己人就开始打自己人了，如果外星人忽然出现现在又该怎么办！”
对于拉斐尔教授的话萧然也只能歉意一笑，对于这位睿智的老人，为了天神而付出了不少的老人萧然是从心里尊敬他的，但离开与否根本由不得他做主，而且这短短时间里越猖狂的举动也是他一手导致，自然这一点是不可能当着拉斐尔教授说出来的，比利在听到拉斐尔教授的话之后也是颇为无奈，谁让如今司令官已经正式落到了他叔叔的头上，而且哪怕是以前也是他的叔叔在安排做事，真要牵连进来他自己也脱离不了关系。
比利一边轻轻拍着拉斐尔教授的后背，一边说道：“老师消消气，将军当时离开也应该是有必须的理由，现在将军也回来了，应该是办法解决现在的情况的。”
等到比利的话音落下，娜洛便走了进来并且手上还端着一个放着三杯咖啡的盘子，等到娜洛如同秘书一样将咖啡放在三人身前，萧然才转头对着娜洛说道：“出去守着不要让任何人进来打扰我们的谈话。”
娜洛点了点头和拉斐尔教授，比利两人打了个招呼就再次离开，守在了办公室门外不准任何人进入萧然的办公室。而直到大门关上，萧然才对着两人说道：“当初我的离开的确是有不得不离开的理由，当时我就已经察觉到了联邦内部之中有着异常的动静，而且被安插进来的古德曼虽然明面上听从我的指挥，但实际上却是联邦和某些人安排内部限制我的一颗棋子。”
“就算我想要留下，也有人不会愿意我继续留司令这么一个重要的位置上，如果内部的古德曼和外部的联邦总部一同施压，在那种世界最需要安稳的时候我也只能被迫的离开说不定还不知道会被配到什么地方去，而一旦反抗或许就会被视为叛逆悄悄的讲我处理，既然如此还不如主动一点自己离开留下一个好名声为回来做好打算。”
萧然所说的这些拉斐尔教授也能理解，不过就是因为太生气于现在的联邦才会对萧然说出刚才那样的话，拉斐尔教授确实也能感觉到此时的联邦和经被一只黑手所掌握，有些事情的确也是无可奈何。
拉斐尔教授沉默了一下，然后问道：“那你现在准备怎么做，世界的局势绝对不能在混乱下去，而且这支部队的存在也影响到了世界的和平，同样不能在容忍恶心在持续，否则将会有更多无辜的人因此而牺牲，也会有原本应该作为抵抗外星生命中坚力量的人白白死去。”
萧然点了点头，说道：“我知道而且我也已经有了安排，而且在这四年里我也没有浪费时间，而是带着家族力量展出了足以改变这个世界的东西，对于现在的联邦和想要做的就是推翻现在的联邦政府，成立一个新的联邦政府。”