朝廷奖赏第五镇的圣旨发出后不久，孚琦弹劾龙谦的奏折到了。孚琦没有用电报的方式，而是用旧式的快马送达。所以时间晚了些。
其实，朝廷在接到孚琦的奏折之前，已经获悉了广东连续发生的流血事件。广东局势甚至引起了外国使节的关注。
随即，龙谦一份长电抵达北京，详细报告了自己整顿巡防营的目的和广州、肇庆两府冲突的过程。龙谦在电报中指责了孚琦袒护罪犯的行为，认为正是上下勾连纵兵为匪才导致了广东乱局难平。若想让广东长治久安，非得用霹雳手段不可。
这份电报自然比孚琦的奏折快的多，朝廷还没有来得及表态，孚琦的折子到了。
孚琦的报告终于改变了慈禧的态度，她终于被激怒了。一件事一件事地叠加起来，龙谦难逃“跋扈”的评语。或者说，“跋扈”是最轻的了。即便是当初创立湘军削平洪杨之乱的曾国藩兄弟，也没有龙谦这样的跋扈行为。他今日可以藐视广州将军，明日当可藐视两广总督，最后当然连朝廷的旨意也不当回事了。
怎么办？慈禧召集心腹大臣研究。奕劻和张之洞作为军机处的满汉领班，都劝慈禧慎重行事。但那桐、世续及刚进军机处学习行走的光绪帝之弟醇亲王载沣却主张免掉龙谦军职，将其召回京师另行安置。
奕劻问几个年轻人，如果第五镇生乱，该当如何？
“发大兵过去！灭了这个忘恩负义的竖子！”载沣叫道。
“发兵？第五镇战力之强你们都看到了。没有三个新军镇不足以万全。若是调三镇新军南下广东，需要多少银子？需要多少时间？最为可虑者，需要派谁统带？另外，山东要不要防备？”奕劻虽然贪腐，但十几年身处核心的经历，使得这位首席军机的问题极为尖锐。
事实上，自广东危机爆发。奕劻受到两方面的“夹击”。一个自然是龙谦一方，奕劻受到邢冬云转来的龙谦的要求，很客气，很详细但也很明确，便是要庆王爷代为在太后面前转圜。另一个就是袁世凯方面，袁世凯希望庆王能够说服太后对龙谦动武。
袁蔚亭的目的奕劻一清二楚，那就是借机名正言顺地拿回对北洋军的指挥权。
抛开两方私利。奕劻站在朝廷的立场上想来想去，认为动武绝不可取，主要的原因还是钱。做最坏的打算，实施一场针对龙谦的大战，朝廷没有一千万的军费根本就别想。那不是一个广东，还有一个山东横在那里！
山东也是朝廷心头的一根刺！杨士骧身为山东巡抚。态度越来越暧昧难明。而据王怀庆的密报，山东巡防营实有兵力绝对超过了一个新军镇，他们甚至已经编组了完全新式的组织，自称山东纵队，设了旅团的番号，光是十一月，山东巡防营就进行了两次规模巨大的军事演习。参加的部队超过了五千人。
最为可虑者，山东巡防营（姑且如此称呼吧）根本就不理会朝廷，他这个山东提督连巡防营的军营都进不了！
“太后，”张之洞看慈禧脸色越来越差，“臣以为庆王爷的意见是对的，目前绝不能采取军事解决的方式。”
“唔？你们几个说说？”慈禧将目光转向了几个满洲“千里驹”。
“为什么不行？”载沣在下面与铁良、溥伟、良弼以及从德国学习陆军回国的，与北洋军有着极深渊源的荫昌反复计议过了，“南方有第八、第九两镇可以动用。北洋至少可以出动三个镇，两路用兵，一举解决山东和广东，正其时也。”
“你不要说了！”慈禧失望地对载沣挥挥手，“张之洞，你觉得此事当如何处理为妥？”
“龙谦反迹未明，不宜以军事相威胁。而且他身为提督。整顿本省巡防营乃权责所在，没什么可指责的地方。若是当地驻军得力，朝廷又何必派第五镇南下两广？两广地理特殊，又是孙文乱党重点活动的区域。如果给乱党机会就得不偿失了。所虑者，乃其借整顿之机扩大实力也。为今之计，可下一道谕旨切责于他，令其暂停对巡防营的整编。如果他遵从，过一段时间另找个机会将其调入中枢可也。”张之洞虽老迈，但头脑一点不糊涂。
“此乃老成谋国之言。就这样办吧。但北洋诸军要加强训练，以备不测。”慈禧不再征求其他人的意见，立即做了决断。
她知道龙谦练兵的本事，从一支千余人的小部队，几年内便拉出了如此规模的强军。以为调走了第五镇便可掌控山东，没想到龙谦离开了山东，山东依旧针插不进。若是任由其在广东发展，谁知道第五镇会发展到什么规模？如果给他再练出两个镇，朝廷岂不是更拿他束手无策？
11月24日，军机处发出了一封以慈禧口气措辞严厉的电文给龙谦，“闻广州府士绅上书，报广东提督龙谦擅自撤编该府巡防营，多有冲突死伤，导致该府民怨沸腾。着广州将军孚琦核实其事。提督龙谦未经广州将军孚琦允准，亦未请示中枢，擅改朝廷大政，深失朕望……姑念该员效力多年，薄有微功，着令停止广东全省巡防营之整编，恢复旧制。”
11月26日，就在对广东的明发上谕斥责的第三日，朝廷对山东也动手了，调杨士骧署理直隶总督，派良弼出任山东巡抚。
种种迹象表明，甚至连当初一力保举杨士骧为山东巡抚的袁世凯都密奏慈禧，杨士骧已与龙谦沆瀣一气，诚可虑也。为了不惊动山东，朝廷虚出了直隶总督的高位，计划先将杨士骧调出来，拉过来，从而瓦解已自成体系的山东省。
本来，接替杨士骧的人选有两个，吴廷斌和袁树勋。前者为山西巡抚，后者刚从顺天府尹转为民政部左侍郎，资历都是够的。但吏部这个人选报上去。立遭慈禧痛骂，年纪较轻的吴廷斌都六十开外了，都是文官，哪里能管得住山东？最后，良弼自告奋勇，愿意弃武从文，去接替杨士骧离任后的山东巡抚。
朝廷万万没有想到。杨士骧竟然拒绝了朝廷升官的诱惑，声称自己体弱多病，目力衰竭，早已不堪驱驰，请求辞去山东巡抚之职，回乡终老余生。
杨士骧辞官为本来就紧张的局势再舔一把火。为此。袁世凯急令杨士琦亲赴山东，劝说其兄回心转意，但无果。杨士琦回北京后，报告袁世凯说其兄确实心力交瘁，不堪驱策了。
拖延了数日，清廷终于下了决心，免去杨士骧山东巡抚之职。着良弼署理山东巡抚。
矛盾终于激化了。
11月29日，山东局势尚未明了，龙谦再次电奏朝廷，为自己整顿广东巡防营而辩解。这不过是争取时间的一招，不管有没有用，先发一份电报再说。电文是洪粤诚代为起草的，文辞极佳，通篇充满了委屈的味道。对自己一心为朝廷反而受斥责很不理解。最后讲了，广州、肇庆巡防营已改组完毕，各自成立了一个旨在弹压地方维护地方治安的保安团，无法恢复旧制了，其余地区照朝廷谕旨暂不动了。但两个保安团业已编成，不宜再变。
11月30日，两广总督周馥电奏朝廷。肯定了龙谦的意见，认为广州府目前已经平静，不易再动了。
孚琦没有消息。
这一次朝廷反应迅速，12月2日。军机处电示广东，既然广州、肇庆两府巡防营已经改编完毕，可不再变动。唯广州、肇庆保安团之指挥权归广州将军，所有官佐，均须广州将军认可。
这是明确无误的信号。
接电后，孚琦立即派员联系龙谦到将军府议事。龙谦却不在广州，第五镇司令部说统制官去肇庆府了。来将军府接受命令的是第五镇参谋长司徒均。孚琦对司徒均说，听说贵部派了一批军官到保安团任职？司徒均说是。原有的官佐很不称职，提督大人从第五镇遴选了一批军官帮着保安团练兵。孚琦说，龙提督的用意是好的，但贵部军官都是北方人，人地两生，言语不通，多有不便。而保安团乃地方武力，还是用当地人为好。我想，还是让他们回去好了。司徒均问什么时候调回去，孚琦说我想检阅下保安团，待检阅仪式后，你就可以将你们的人调回去了。司徒均问何时检阅，孚琦早有成计，说四天后，就在法政路学校操场。司徒均答应了。孚琦说，给龙提督带个话，届时请他也来，毕竟这个保安团也有他的心血。司徒均说将军大人的话我一定转告我家提督。
孚琦的想法很简单，就是从此建立忠于自己的武装部队，广州保安团就是第一支。看到第五镇知趣，孚琦心里很高兴。
龙谦并未去肇庆，他就在第五镇司令部“藏着”。司徒均回来后报告了龙谦去将军府的情况，龙谦面无表情。一个几百人尚无战力的保安团并不是什么要紧事，他在考虑朝廷的真正态度。但是当晚收到了一份来自山东的电报，只有四个字“岳父病重。”
这份电报让龙谦紧张起来，立即下令召回王明远、封国柱等人。
电报是约定的密语。岳父病重就是指山东发生了不利于蒙山军的重大变故。如果是长子病重，则是指关外鲁山，妻子病重则是中枢有不利于自己的重大决定。
电报局不在自己掌握之内，这样做是没得办法的事。山东出了什么问题现在不清楚，龙谦必须做最坏的打算。
12月4日晚的会议参加者只有八个人，龙谦、司徒均、王明远、封国柱、连树鹏、曹敏忠及代理情报处长的王之峰。记录是欧阳中，不过他没有发言权。
“十有八九，朝廷更换了山东巡抚，其他的，我想不会。”与山东的联系一直正常，龙谦不认为部队会出什么问题。
“可是，为什么他们要动山东呢？”王明远很是不解，“之峰，什么时候能收到山东准确的消息？”
“不好说。江处长就在山东。或许情报已经在路上了。”
“司徒，通讯问题必须解决了。向美国人买的远程收发报机什么时候可以到？”
“还不清楚。应当跟刘晓琪一同回来。”司徒均摇摇头，他对无线电玩意儿也不懂，至少德军尚未装备，至于可靠性就更谈不上了。参谋处组建的通讯科目前还在草创，因为龙谦指示以无线电通讯为主，所以拼命收集这方面的资料加以学习研究。
“弟兄们，必须做最坏的打算了。看来满清是要先解决咱们了，他们明白，不动山东只动广东不行了。树鹏，部队的武器弹药情况如何？”龙谦手里有装备处详细的报表，但他还是问了连树鹏一句。
“山东最近连续送来两批枪械弹药，计有步枪四千支，轻重机关枪七十三挺，迫击炮二十四门。部队枪械火炮都没有问题，但如果大规模扩编就不够了。子弹炮弹及手榴弹都是按计划运送的，够七个基数。”
七个基数就是七天的消耗。但消耗的标准定的比较高，是按照与德军交战的消耗确定的，如果是与北洋军打，省一些用，或者还有缴获，至少可以坚持半月或者更多。
“立即通知山东开足马力生产，雇佣德国人或美国人的轮船再送广州几批。并尽量从礼和洋行手里购买弹药，特别是炮弹。”
“是。”
“我倒是觉得，应当着手扩编部队了。”封国柱说道。
“大规模扩编？民心未附哪。尤其是出了惠州事件之后……”龙谦苦笑。
“司令，是我做的不好……”一手导演了惠州血案的王明远难过地说。
“哪里，这是肯定会发生的。必须打碎了重来，我们可没有时间慢慢改造他们。下一步还要继续搞下去，不打掉巡防营，我们就不能没有后顾之忧地北伐。我倒是觉得，跟朝廷不会这么快就摊牌的……”
“司令的意思是？”司徒均问。他觉得龙谦身上有很矛盾的东西，大部分时候是无神论者，但有时候硬是相信毫无事实依据的直觉。
“是的。你想的没错。我觉得这次危机有可能和平度过。我们需要时间，至少一年的时间。但是必须立即制订北伐的计划了，总的思路是山东主守，我们主攻。”
“十八镇呢？”
“由山东给他们去电，但部队暂时不要集结。山东也先不集结，但要方、陈、宁、叶四人做好万全准备！另外，树鹏，你的担子很重，除掉枪炮弹药，粮食、药品、被服、运输车辆及民夫的征用都要做一个计划出来。”
“是！”
“是不是发一个预备命令？随营军校里还有一大批下级军官，部队没有他们不行。”司徒均问。这显然是针对第五镇的，现在部队分散四处，十分不利。
“先等一等。”龙谦想了想，“朝廷没那么快。今天的会议不要外传，明白吗？”他挥挥手，“我要一个人想一想。”
于是散会了。
但是王之峰留了下来，“司令，有一个情况，完全可以利用。”
“什么情况？”
“我们在同盟会那边有人。最近他们准备在广西镇南关策划起义了，我们的人已经来了广州，取得了联系。”
“回广州做什么？”
“狗日的，竟然准备对您下手了！”
“哦？”龙谦来了兴趣。