因为日本这边军、政要员全都被催眠控制住的关系，无法使用当地国士兵进行袭击的SEELE就算想找事也是鞭长莫及，所以接下来的时间正式进入了平稳安定期，让伊藤成可以安心的对付随时到来的使徒们。
当然，所谓的对付也只是单方面的杀戮的而已，所以仅过了不到三个月，不管是在宇宙中飘着的鸟天使，还是没有固定形体的子宫天使，亦或者其他使徒尽数被伊藤成斩杀殆尽，变成了世界之树进化用的食物肥料。
“我准备要离开了。”这天，在可以俯视地三新东京市的山道平台上，伊藤成对身边依旧一席黑色连衣短裙，外加一加红色皮衣外套，一头黑色长发自然批散的葛成美里说道。
“你能带着所有人一起离开吗？”双手支在身前的护拦上的葛成美里轻声问道。
“你想让我带走谁？”伊藤成饶有兴趣的反问道。
“……，日向、青叶、还有加持。”葛成美里犹豫了片刻后说道。
“你的心还真宽广。”伊藤成怪笑道。
“混蛋！我跟你说正经的呢。”知道伊藤成话语意思的葛成美里气喝道。
“很遗憾，我对他们三个无爱。”伊藤成微微摇了摇头说道。
“……”葛成美里沉默着。
“看来我们两个注定没缘份呐。”伊藤成轻声叹息道，然后转身走到葛成美里身前，静静的与她对视在了一起，接着缓缓压下头，突然亲吻在了躲无可躲的葛成美里的嘴唇上。肆意的品尝着。
“这个就当是临别赠礼吧。”片刻后，伊藤成放开气喘吁吁的葛成美里笑道。
“不要太想念我呦……”余音渺渺中，伊藤成的身影缓缓地自葛成美里的眼前消失不见。
魔方世界内，那座存放着EVA初号机的无人岛上，突兀出现在这里的伊藤成动念将正在大实验室内忙碌的碇唯召唤到了身边。
“恩？有什么事吗？”突见周围空间变换的碇唯一脸疑惑的看向伊藤成询问道。
“我准备给你弄一个新的身体。然后将初号机毁掉。”仰头看着静立在此地的初号机的伊藤成轻声说道。
“为什么？”碇唯有些不明所以的追问道。
“我需要初号机成就另一个对我来说很重要的东西。”收回目光转头看向由量子纠缠态构成身体的碇唯解释道。
“和之前被你取走的零号机、使徒尸体、莉莉丝身体的去处一样？”碇唯歪头问道。
“恩。”伊藤成确认道。
“那好吧。”通过之前的询问，大概知道那件东西的重要性的碇唯答应道。
“谢谢。”伊藤成感谢道。然后就身体构成方面对碇唯询问道“关于你的身体，我这里有三种方案供你选择，一是使用绫波丽身上现有的细胞和样本重新克隆出一副躯体，然后将你的灵魂放入其中。”
“二是使用魔法文明的手段，为你制造出一副能量物质化后的强大身体。”说到这里。伊藤成伸手在半空中制造出一大块虚拟屏幕，将夜天之书、守护骑士系统、念动之核、以及能量物质化等方面的东西一一向碇唯展士了出来。
“最后一种，依旧像现在这样，选择一件物品进行依附，成为凭依灵。”
“真实身体、能量物质身体、和单纯的鬼吗……”碇唯看着眼前虚拟屏幕中暂时出的三种形态轻声自语道。
“我选择第二种。”随后，碇唯决定道。
“好。”挥手将半空的虚拟屏幕湮灭的伊藤成点头答应道。“你先接触现在的状态回到初号机内吧。剩下的由我来负责。”
“好。”碇唯答应道，随即身形一闪，化做无数的光子颗粒自伊藤成的眼前缓缓地消融进了虚空中。
见此，伊藤成也不迟疑，当即放出精神力进如初号机的核心虚数空间内部，找到正在里面等待的碇唯的灵魂，操做着精神力演化成一个拘灵法阵。罩在了碇唯的灵魂体上将她束缚包裹住，然后在碇唯本身意念的配合下，将她从初号机核心内的虚数空间中拉扯了出来。
瞬间，碇唯那虚虚乎乎的灵魂形象便出现在了伊藤成眼前。接着伊藤成手臂一挥，释放出一道灵气投入进碇唯的灵魂体内，一边重塑她的灵魂躯体，一边帮助她稳定灵魂形象。
随后伊藤成暂时将碇唯的灵魂放到一边，动念联系上魔方调集出一团至精至纯的纯净能量，用术式将其压缩成珍珠大小，凝炼成最初的念动之核。然后开始在地面刻画相应的法阵。写入相关的魔法程序信息，将念动之核与碇唯的灵魂放入到了法阵的中心处。
“等下无论发生什么都不要抵抗。”伊藤成看着碇唯嘱咐道。
“我知道了。”碇唯答应道。
得到肯定答复的伊藤成也不在废话，动念激活了身前的术式法阵。
瞬间只见整个法阵突然一亮，绽放出明亮却不耀眼的亮白光芒，紧接着位于法阵核心处的念动之核与碇唯的身体也是同时一亮。并在一种无形的力量牵引下缓缓地向一起融合着。
这种融合的过程很快，还不到一分钟，便再一道更加明亮的光芒中融合到了一起。
这时，被刻画在法阵周围内外一直没有任何动作的魔法信息却是突然流动起来，一个接一个涌入那还在发光的椭圆形光团内，迅速消融到了光团中。
“啪！”接着又过了大概一分多钟，伴随着一道清脆的裂响声，包裹在碇唯身体外的椭圆形光膜瞬间炸裂开来，将里面浑身上下一丝不褂的碇唯的身体的重新暴露了出来，呈现在伊藤成的眼前。
“呀~”受风一吹，感觉到自身异样的碇唯下意识的发出了一声低呼，并用双手将自己身上的春光遮挡住。
“你现在已经有了魔力物质身体，所以想要衣物什么的除了外部购买外，你也可以直接通过想象用魔力制造出自己想要穿得衣服。”翻手变出包括胸罩内裤在内的所有内外衣物用念动力送到碇唯身前的伊藤成述说道。
“不过我要提醒你的是，魔力服装是战斗用防护着装，只能设定出一套，你要小心使用。”
“你能不能转过去。”碇唯请求道。
伊藤成也不多话，直接将身体转了过去。
看到伊藤成转过身，碇唯立刻拿起漂浮在身前的衣物一一穿着了起来，没一会就又恢复成了一派科研少妇的形象。
“好了。”碇唯说道。
“今天放你一天假，好好熟悉现在的身体，亦或者设计出自己的魔力防护服，等明天在去实验室那边继续工作。”伊藤成说道。
“好的。”正好也想借此机会去看看真嗣的碇唯答应道。
随即伊藤成动心转念，将碇唯送回了生态城市内，自己则带着已经成了空壳的初号机出现在魔方大陆中心的世界树面前，将初号机也交给了世界树来吞噬。
一分钟后，伴随着初号机的彻底消失，世界之树的树身猛的一颤，一股强大的生命气息波动从世界之树上扩散开来，搅动着周围一方空间微微一震，同时一大团一大团的天地能量与富裕的世界之力从虚空中飞射过来，没进了世界树的树身当中。
而在伊藤成无发看见，但却可通过魔方感知到世界树的顶端枝叉上，一个翠绿的新生嫩牙长了出来，并在世界树本身的能量供给下缓慢的生长着。
“也不知道到时候会生出什么，是传说中的精灵，还是新的使徒生命……”伊藤成心头暗忖道。
而后伊藤成不在理会在亚当、莉莉丝、使徒、EVA、朗基奴斯枪等出自新世纪福音战士世界产自诞生宇宙一切的卡巴拉生命之树的产物的滋润下又觉醒了孕育生命能力的世界之树，闪身出现在了魔方世界的虚空中，下达了返回主世界的命令。
“噼里啪啦……”熟悉的玻璃制品碎裂声中，伊藤成回到了半位面内，然后展开次元转移魔法阵回到了秋留野市的神社家中。
“还没突破么……看来还要等上一段时间啊。”往伊藤老爷子闭关的地方看了眼的伊藤成轻声说道，随即回到因为没有其他人在而显得有些冷清的房间内休息起来。
接着第二天，伊藤成在留下了一个影分身注意着主世界这边的情况后，真身进入魔方世界内，陪伴起了家人和自家的女人们，或游玩打闹、或合籍双修的度过着等待的时间。
当然，为了不厚此薄彼，伊藤成也在中间抽出一天时间回到主世界去陪因到了年末而稍微变得有些忙碌的仓木麻衣和同他有着些许暧昧关系的长泽雅美，以及前去看望一下镇守在魔法塔内，正努力向S级大法师突破的英格丽。
如此过了一个礼拜之后，依旧未见老爷子突破，但感知到主世界空间震荡平复，关注低重新恢复到最低点的伊藤成再次通过半位面进入到魔方世界内，踏上了前往新世界的旅程……