这场时代大戏情节一转再转，先是数码世界被皇帝巴古拉兽占领，然后它一手联通两个世界。之后兄弟阋墙，暗黑骑士兽突然出手偷袭。然而皇帝巴古拉兽早有准备，暗黑骑士兽一败涂地。
当那首不详的预言诗响起，大家恍然大悟，以为这就是一切的归宿与终结。却没想到皇帝巴古拉兽居然没有按照预言所说来做，竟是将赤黑的双头龙强制合体到蛇铁封神丸中。这下让所有人都看不懂了。
“最后的时刻即将来临。诸君就一同观看这最后的终焉时刻吧！”皇帝巴古拉兽的身姿不断拔高，没入虚空。
“皇帝巴古拉兽就要降临人类世界了！”生化莲花兽惊叫道。
“什么？！”工藤大器大惊，“不能让它那么做！”
“我们也到人类世界去。”玛尔斯兽提议。
在黑暗石融合的同时，数码世界各个zone也在发生惊人的变化。分裂的天空与大地渐渐靠拢，仿佛又将变回古代、远古那般无限宽广。只是这世界却是黑暗与绝望的世界。被怨恨、诅咒纠缠的数码兽们都看到了皇帝巴古拉兽升入天穹的雄姿。
“是姐姐大人！”天野琴音眼尖，一眼就看到了正跟随皇帝巴古拉兽飞升的魔女音音。天野悠和苍沼切羽也猜出皇帝巴古拉兽的目的，他们相对而视，同时点头。
人类城，藤枝淑乃与蔷薇兽X也明白现在恐怕就是最后时刻。藤枝淑乃开始下令，将所有能用得上的战力都调集过来。“希望能够有用……”
同时，发生可怕异变的地球上，距离异变发生地点最近的龙野剑、松田启人与混沌骑士兽、八神太一与天翔V龙兽、城户丈与海狮兽聚集到古宇利大桥，仰望天之尽头出现的巨大时空空洞。
古宇利大桥是连接冲绳县古宇利岛与屋我地岛的跨海长桥，在满眼蔚蓝的水域中被称为“霓虹绝景”。而然现在，出现在龙野剑面前是赫然是满眼紫黑色的汪洋与黑云密布的天空，一只从天而降的巨手犹如五指山一般横跨长桥东西深深扎入海床，仿佛一手抓取了大地！
“那个东西，要来了！”松田启人皱眉凝神地注视着越来越大的时空空洞。八神太一和城户丈也察觉到最终boss就要降临。
当皇帝巴古拉兽那庞大的身姿穿越虚空从时空空洞中缓缓降临时，那汹涌的时空波动仿佛要将人类世界也搅成碎片。
流星——
紫色数码之魂在天空留下痕迹。
能够如此之快赶来的唯有陆峰。
“暴君陛下，何必如此执着？”皇帝巴古拉兽凝视看似渺小的陆峰，“人类与数码兽纠葛亿万年的命运就此结束，不是最好的选择吗？你我若能结合，将诞生出超越一切的新力量！”
“毁灭一切，然后再创造全新的一切吗？”陆峰扫视四方，视线最终停留在八神太一与松田启人身上，“听起来很不错，只是，有很多东西我都不想放弃。”
听到陆峰拒绝，皇帝巴古拉兽也不恼怒。“也罢，现在的你的确还有所欠缺，那就只能……喝~！”强横的黑暗能量勃然怒放。被时空冻结的海水、大地所有物质竟然就此数据化，被皇帝巴古拉兽纳入体内。转眼间大地被剜出一块数十公里的巨坑，并且还是极速扩大。
“你在干什么！？”陆峰、八神太一大吃一惊。
暴君神威再次现身，混沌骑士兽、天翔V龙兽也在第一时间放出必杀。腐蚀一切的黑暗波动朱迪卡监禁（JudeccaPrison）与超高温蓝色光矢天翔V龙箭（V-BreathArrow）直冲皇帝巴古拉兽而去。
面对敌人的攻击，正在爆气晋升的皇帝巴古拉兽只是轻轻挥动战刀，赤黑龙骑士仿佛发出最绝望的嚎叫，恐怖的气浪甚至将天翔V龙兽掀飞。
皇帝巴古拉兽气势一停，肆虐的飙风顿时一滞，带起满地烟尘。城户丈还在奇怪皇帝巴古拉兽为什么突然停下。陆峰却能看到，与之前相比，一直立在巴古拉兽左肩的时钟兽有了惊人的变化——时钟兽的下半身居然与皇帝巴古拉兽融合在一起！
难怪皇帝巴古拉兽能够如此自如地调用时间之力。在皇帝巴古拉兽的努力下，时钟兽与它的融合程度正在极速提升。将空间之力运用至出神入化的皇帝巴古拉兽，加上掌握时间之力的时钟兽，这并非不可想象的晋升方式。让陆峰奇怪的是，它为何不直接让魔女音音直接使用强制数码组合呢？
虚空中，由皇帝巴古拉兽开辟的通道中，工藤大器正带领XrosHeart往人类世界赶去。
“等一等。”工藤大器腰间的X-Loader突然显示贤者兽的头像。
“怎么了，贤者兽？”工藤大器问道。
“我是在想，虽然大家都要去人类世界战斗，但说句实话，以大家现在的力量，是很难帮上忙的。”贤者兽解释道。
剑善次郎激动道：“即使是那样也要去啊！如果人类世界也被皇帝巴古拉兽毁掉的话……那样太可怕了！”
咚~
阳本明里一手刀解决了鬼嚎的剑善次郎。
“其实我有个新的研究，是从DoubleXros得到的灵感，也许可以让高吼兽变得更强。”贤者兽道，“但是还要苍沼切羽和天野琴音帮忙。”
大家都在赶往人类世界，但因为地域不同有所先后。工藤大器并没有等待多久就见到了苍沼切羽和天野兄妹。
“……麻雀兽能增加飞行能力，而且对敏捷和火力的提升非常明显。也只有你们三个人联合起来才能将这种组合完成。”
“既然如此…”三人对视，下定决心。工藤大器首先举起红色X-Loader，“奥米加高吼兽、弩机兽、多路路兽、星星兽！”
“吉克暴龙兽！”苍沼切羽。
“麻雀兽！”天野琴音。
“雄伟合体！！”X3。
“GoldDigizoid?”点亮炽热的心灵，发出神圣的灵气。金泉喷涌，强劲的力量荡漾出无尽黄金雾气。雄伟合体而成的闪耀黄金光芒的雄伟身姿，终极的融合神爆发（ArdhaBurst）形态——高吼兽X7！
天野悠羡慕的呢喃着：“不行兽，我们也不可以输给他们啊！”
高吼兽X7诞生的瞬间，三位指挥官璀璨的XROS·CODE在虚空通道中交织，散发着奇艺的波动仿佛沟通了神秘的大门。
铿铿铿铿铿——
“什么声音？！”阳本明里扭头一看，悚然而惊。只见一道道门户在虚空通道中层层开启。目光延伸，能见到一扇华美巨门出现在数码世界极高之处。宗教式的门柱上勇气、友情、知识、爱心、纯真、诚实、光明、希望、奇迹九枚符文华光普照。
再蠢笨的人此时也觉察出不对，工藤大器脸色凝重面对自行从X-Loader遁出的贤者兽道：“贤者兽，你这是在做什么？”
“皇帝巴古拉兽与时钟兽融合，生命本质蜕变在即，我也是逼不得已。”贤者兽似是在解释，又似在追忆，“黑暗石被带入人类世界，数码世界的存在之基被削弱到极点，否则天顶之门要脱离数码世界顺利开门可不容易。皇帝巴古拉兽联通两个世界，这样一来，我主甚至能降临人类世界……”
“这家伙到底在说什么？”阳本明里不明所以道。
咚~！
一声闷雷轰响声传两个世界。
人类世界，陆峰与八神太一等人俱都眺望虚空通道。
“来了…”皇帝巴古拉兽转身，手中战刀·赤黑龙骑士嗡鸣不止。
虚空通道尽头，一只玉质大手推开巨门。那门扉在无形之力支配下急于闭合，却顶不住大手巨力，终于被一拳轰开。
“天顶之门！！”“天顶之门已经关不住无圣了！？”“难道数码世界就要在今天终结？”……
一只拳头便有百米，不待天顶之门再次闭合，无圣把手扶住门板，玉质肌体勾勒的块块肌肉仿佛游龙，恢弘伟力下就是一扯。
哐当~~一声，一扇门板竟是被成成扯掉！门户大开的天顶之门泄出种种混乱光色。
“那究竟是什么怪物！？”阳本明里惧怕地以手掩口。
“那可不是怪物……”藤枝淑乃和蔷薇兽X也赶到了，“那可以说是数码世界的秩序双蛇之一——无圣！”
“秩序双蛇？无圣？”知识面很广的天野悠第一时间理解了藤枝淑乃的意思，秩序双蛇那可天然就是世界上最强大的存在。
“不不不！”贤者兽摇头，“吾主本位神圣象征，善行之光普照世界。但在吞噬古蛇之后，吾主已是数码世界唯一的至高！当呼其圣名——黑天主！！”
轰轰轰轰——
一双大手撑住门框，龙首人身的伟岸身姿跨门而出。彼时，邪恶秩序之光满溢，折射万方无穷。三百六石座封印门户同时炸裂，轰鸣巨响刺穿虚空。
黑天主以全新的形态踏足虚空通道。