黄帝与蚩尤的这场大战十分惨烈，直杀得天昏地暗，尸横遍野。
然而风伯雨师在天上终于不敌应龙，负伤飞走，蚩尤败局已定。
《云笈七签·纪传部》云：“（黄帝）驱应龙以处南极，杀蚩尤与夸父。”
蚩尤天生神体，即使手脚、头颅被斩断，拼接之后依然能迅速复活。所以趁蚩尤被应龙的雷霆之击撕裂虎躯，片刻之间无法恢复时，黄帝赶紧用利剑将他大卸八块，这才惊魂未定地擦了擦汗。
他命人迅速地将蚩尤的尸块运送四方，分别葬在相距非常遥远的几个地方，又用咒符镇压，避免蚩尤再次复活。蚩尤的众多兄弟也尽数被诛。
黄帝遂威震天下，铸九鼎，立九州，成为天下共主。
他感激玄女功德，尊玄女为“帝师”。
玄女在道教中地位崇高，被认为是至真天仙，乃大道衍化、南方离火炁所化生，称之为“九天玄母天尊”，是九天道法之祖，符籙法咒之宗。
玄女在女仙神系中地位仅次于西王母，掌管天机秘典，历史上多次应劫显凡，真形幻相，形态不一。
在各种历史传说中，春秋时助越亡吴、薛仁贵征东、刘伯温得兵法、汉高祖建都皆与九天玄女有关。
应龙在此战中立下汗马功劳，但祂消耗了太多神力，无法返回天庭，于是蛰居在南方的山泽里。《山海经·大荒北经》云：“应龙已杀蚩尤，又杀夸父，乃去南方处之，故南方多雨。”
女妭也再也飞不回天空，只好留在人间。她的所居之处常年干旱无雨。
风伯雨师倒没啥损失，继续做祂们的风雨之神。
根据记载，“风伯雨师”很早就被人们祭祀崇拜，秦汉时已列入国家的祀典。唐宋以后，雨师的地位被从佛教中脱胎出来的龙王所取代。
在黄帝众妻子中，嫘祖首先驯养家蚕、创造蚕丝业，被人们奉为“先蚕娘娘”，又有懿德，于是成了黄帝的正妃。
轩辕黄帝大战蚩尤是中国上古时代极其重要的事件。黄帝胜利之后一统中原，成为华夏共主，位列“五帝”之首。
中国以儒家思想为主流，一向强调“正统”，史家又多有“成王败寇”的传统，因此“黄帝战蚩尤”逐渐被描述为正义与邪恶的战争，以《史记·五帝本纪》为代表，流传甚广。
然而历史上对蚩尤的恶评未必公允。《山海经校注》云：“盖夸父与蚩尤同为炎帝之裔，在黄炎斗争中，蚩尤起兵为炎帝复仇，夸父亦加入蚩尤战团”。
涿鹿之战后，黄帝的帝位日趋稳固，但部落众多的华夏大地依然有许多人表示不服。
刑天就是其中之一。
他是一名身强力壮的上古巨人，本是炎帝手下大将。炎帝在坂泉之战中被黄帝打败，刑天和其他部下都很不服气。
当蚩尤举兵对抗黄帝时，刑天很想去参加这场战争，但炎帝此时已经臣服于黄帝，坚决阻止了刑天的行动。
如今蚩尤失败，惨遭屠戮，刑天再也按捺不住心中的熊熊怒火。他带领他的儿子和手下揭竿而起，发誓要和黄帝争夺帝位！
谁也拦不住英勇善战的刑天。这位巨人左手持盾，右手拿斧，一直杀到黄帝的宫前，大叫着要与黄帝决一高下。
黄帝大怒，提起切金断玉的昆吾宝剑就和刑天打了起来。
他们两人形体相差巨大，但黄帝身上也流着神明血脉，是人中之龙。况且黄帝与蚩尤大战过，虽然略有不敌，但又怎能怕了刑天，让天下人认为他姬轩辕软弱可欺，天天反抗他的统治？
于是两人从宫内杀到宫外，一直杀到了常羊山。
黄帝剑术神通，寻着一个空隙，匹练般的剑光向刑天的脖子砍去。刑天防御不及，头颅被黄帝斩落下来，落到地上，又顺着陡坡向山脚下滚去。
被斩首的刑天厉声惨叫，但他是神人，头颅被削去却可以不死。
他弯下腰，在地上到处找自己的头颅，但由于没有眼睛，所以他没有发现自己的头颅就在常羊山脚下。
黄帝担心刑天找到头颅后会恢复如初，于是举起昆吾神剑向常羊山劈去。
常羊山在一声巨响中被劈成了两半，刑天硕大的头颅滚进了低洼的两山之间。
黄帝浮空，展开咒术，那两半高山又轰然合二为一，把刑天的头颅埋葬在了里面。
失去视力和听觉的刑天通过皮肤感受到周围的微妙变化，知他再也无法寻回自己的头颅，但他依然不肯放弃。
相反，他的怒火与斗志更加猛烈的燃烧了起来。只见他缓缓地站了站起来，那失去了头颅的身躯比以前立得更加伟岸笔直。
他的双手紧紧握着斧和盾，向四周愤怒地挥舞着。即使要以两个**当眼睛，拿肚脐做嘴，他也要不屈地与黄帝战斗下去！
这位亘古的巨人就这样不停地挥舞、不停地反抗着，直到他力竭被杀的那一刻。
常羊山从此阴云郁结，碧天不开，还时时听见闷雷在山谷中轰鸣回响。那是失败的刑天一直不甘地挥舞着武器，要与敌人永远地战斗下去。
来自四方的反抗还在继续。《史记正义》引《龙鱼图》云：“黄帝摄政……。蚩尤没后，天下复扰乱。黄帝遂画蚩尤形象以威天下。天下咸谓蚩尤不死，八方万邦皆为弭服”。
蚩尤是人人敬畏的站神，不仅黄帝要用“蚩尤未死”来震慑天下，后来更有传言说，蚩尤做了黄帝的臣属，成为“黄帝六相”之一，负责掌管天时。
至于夸父，一定会有人问：夸父不是追逐太阳时渴死的吗？又怎么会被应龙所杀？
其实，中国上古的族群名称经常与部落首领同名，所以两个事件所提到的“夸父”并不是同一个人。
夸父的首领被应龙所杀后，剩下的夸父族人逃回了原来的居住地。
这次战争的破坏力足以改变气候，于是战后不久，大地发生了严重的旱灾，太阳象个大火球，烤得大地龟裂，江湖涸干，一片荒凉。
于是，夸父族中的一位英雄向太阳追去，发誓要把太阳摘下来。太阳见夸父发火，也有点心慌，一面向他射出热力，一面加快速度向西落去。
夸父健步如飞，瞬息间追了万里。眼看快要追到太阳落山的地方——禺谷的时候，太阳的热量使他感到头晕目眩、焦渴难耐。
夸父喝干了黄河的水，连渭水也喝干了，还是感到口渴难忍，最后像大山一样轰然倒地。
这就是尽人皆知的“夸父逐日”的故事。