窝阔台即位后，便着手对蒙古漠北地区的治理，遵循成吉思汗制定的《大札撒》（《成吉思汗大法》），授旨曰："成吉思汗原来颁布的法令和敕旨，应予以维护、支持和保卫，不许恶意变动、篡改和混淆"。并在《大札撒》的基础上，又补充了新的内容。为保证新旧《札撒》的实施，规定"谁触犯新旧《札撒》，即按罪行之轻重给以惩罚"，使整个国家纳入了以法治理的轨道。
1229年，制订了赋税法。其中规定，蒙古族中有马牛羊一百者，可抽一；每一群羊中抽一只两岁羯羊作为汤羊；每千户须出骡马、马夫和挤奶人，备诸王、那颜聚会时用。另外，窝阔台还命察乃、畏吾儿台二人到验川勒地方，凿井取水，以迁牧民前去居住；并设置仓库，储备金帛器械，应付对外战争的需要。窝阔台所以实施这些措施，原因是"成吉思汗艰难创立国家，如今可让百姓安定生活，勿再辛苦。"
建立驿站制度。规定各千户须自备人和马，每隔五程设一站赤，人员20名，以供来往使臣使用，"盖以通达边情，布宣号令"。和林至汉地设三十七站赤，敦煌至玉门关有驿站相连，可通往西域。同时鼓励商旅到漠北经商，在价格方面给予优惠。1236年初又开始印制货币，供商品流通使用。
修筑大汗国都城哈剌和林（今蒙古国后杭爱省额尔德尼召北）。蒙古族人称哈剌合林为斡尔朵八里，始建于1235年。城内有宏伟壮观的宫殿，2个商业区，12座佛教寺庙，2座清真寺，1座基督教教堂。全城设东西南北4个城门。窝阔台喜欢围猎，便命回回工匠在和林以北35千米的迦坚茶寒湖畔，建造了春季游猎的行宫，称作扫邻城。在和林以东15千米的山腰上建造了迎驾殿。在原封地建造了叶密立城。
窝阔台即位期间，漠北已形成了与畜牧业相分离的独立手工业。手工业者主要是被俘的外族人，他们一般都在被监控状态之下，在工局里制作武器和生活用品。除此，手工业者也从事农业生产，以做到粮食和菜蔬的自给。土拉河、克鲁伦河上游、谦谦州（今叶尼塞河上游以南）等地出现了定居的农业区.
1229年窝阔台即位后，遣克烈亦惕人速哥出使金国，劝谕金哀宗向蒙古纳"岁贡"，遭金哀宗拒绝。1230年七月，窝阔台汗命斡勒答合儿豁儿赤留守和林，亲率大军伐金。由雁门关入据黄河以东地区，攻占了天城等城堡，然后西渡黄河与陕西蒙古军会合，攻打凤翔府。
次年春，蒙古军攻取凤翔、洛阳及河中诸城。潼关以西、黄河以北尽为蒙古所据。窝阔台汗为了一举灭金，于1231年夏，在官山九十九泉(今灰腾梁，集宁市北)与诸王商议攻金之策。托雷向窝阔台提议说："金主迁汴，所恃者黄河、潼关之险尔。若出宝鸡，入汉中，不一月可达唐、邓。金人闻之，宁不谓我师从天而下乎。
窝阔台汗同意托雷的意见，决定分三路进攻。窝阔台汗统中路军，由碗子城(太行山之隘)南下渡河，由洛阳进攻；斡惕赤斤那颜统左路军，由济南进攻；托雷统右路军自凤翔渡渭水，过宝鸡，过宋境，沿汉水而下，达唐、邓二州。期以次年春，三路军会师汴京。
同年十月，窝阔台汗围攻河中府城(今山西永济西)，经两月战斗，于十二月克之。次年正月，由白坡渡黄河，攻郑州，守将马伯坚降，郑州陷落。金黄河防线瓦解。
托雷出宝鸡，遣使南宋，要求借道并出兵援助。南宋杀死使者，引起蒙、宋交战。托雷分兵攻宋诸城堡，入汉中，进袭四川，陷阆州(今四川阆中)而还。蒙古军进而由金州(今陕西安康)取房州，前锋3000余人在武当山破金兵10余万，取均州，渡汉水，于1231年末进入邓州境内，金大将合达以20万大军设伏于邓州西之禹山，据险以待，而托雷兵不足4万人，十二月以轻骑与金兵战于禹山，佯败诱敌，金兵则按兵不动。托雷又举火夜行，直奔邓州城，合达急忙回兵保邓州，使托雷攻城三日不能克，只好向北攻打汴京。合达统15万大军尾追不舍。托雷令蒙古军："毋令彼得休息，宜夜鼓噪以扰之"，遂一路袭击金兵。
1232年正月，金兵到达钧州(今河南禹县)，托雷派抄思统领精锐部队予以阻击，金兵至钧州南三峰山，被抄思部阻截。当时恰值天下大雨雪，金人僵冻无人色。窝阔台又派来1万名援军前来会合。托雷下令发起进攻。金15万大军被"追奔数十里，流血被道，资仗委积，金之精锐尽于此矣"。合达走钧州，大将蒲阿被蒙军俘获。
三峰山战役后，窝阔台汗至三峰山组织蒙古军继续进攻，先后占领钧、许等河南10余州。金潼关守将李平来降，潼关防线亦破。三月，速不台围攻汴京，金哀宗遣其弟曹王讹可入质。四月，窝阔台汗出居庸关，避暑于官山九十九泉，留速不台以3万兵卒守河南。
同年七月，蒙古遣唐庆入汴京劝金哀宗投降。金将领蔡元杀死唐庆，于是蒙古军决定诉诸武力，不再议和。此时的汴京已粮尽援绝，1233年正月，金哀宗出奔归德(今河南商丘)，速不台围攻汴京，金西面元帅崔立杀死留守完颜奴申、完颜习捏阿布，献城投降，并将两位王后、两位宗王及500名宗室贵族带至蒙古军营。速不台斩杀宗王及其宗室贵族，把二位王后遣送至和林。四月入据汴京。
金哀宗逃到归德，受蒙古军围攻；奔蔡州(今河南汝南)，又遭塔察儿围攻。蒙古再遣使南宋出兵会攻蔡州，答应灭掉金国后，将蔡州以南领地归宋所有。十一月，宋鄂州江陵府副都统孟珙率襄阳兵两万，运粮30万石与蒙古军合攻。1234年正月，金哀宗传位于完颜承麟，自缢身亡。蒙、宋联军入城，末帝死于乱军中，金亡。
金国灭亡后，按照蒙、宋协约，蔡州以南归宋；蔡州以北归蒙古。于是，蒙古大军北还，留速不台镇守河南。可是南宋淮东制置使赵葵却建议乘蒙古撤军之机，出兵收复中原。这一建议得到宋理宗的允准，命赵葵率军6万取汴京，徐敏子西攻洛阳。速不台率军击退了宋军的进攻，使南宋收复三京(汴梁、归德、洛阳)的举动遭到失败。这次交战，成为蒙古决心讨伐南宋的导火线。
1235年七月，窝阔台汗在答兰答入思召集"忽里勒台"（大会），说："先可汗成吉思汗创业垂四十年，今河西、女真、高丽、回鹘诸国皆已臣服，唯宋人尚负隅败盟"。遂议决出兵宋朝。
蒙古军分三路向南宋进攻。阔出及忽都图取中路，向襄(襄阳)、郢(今钟祥)进军；阔端取西路入四川；口温布花统汉军万户取东路，经略淮河流域，形成了向南宋全面进攻的态势。1236年，中路军曾下襄、郢，虏获百姓及牛马数万而还；西路军入四川，占领成都，秦、巩等20余州皆降；东路军攻庐州未果。蒙宋战事此后又缓和了一段时间.
1225年十二月，大蒙古国受贡使着古欤自高丽返回蒙古至义州（高丽境内）时，被盗贼所害。蒙古汗廷怀疑这一举动是高丽朝廷所指使。因当时成吉思汗刚从西域回师，又征西夏，无暇顾及此事。窝阔台即位后，以高丽杀使者为由，于1231年八月命撒礼塔率师讨伐高丽。
蒙古军入据高丽后，洪福源率民1500余户前来迎降，附近州郡亦有来降者.撒礼塔在洪福源的协同下先后攻取40余座城，高丽王遣其弟怀安公王乞降。撒礼塔在高丽设置京、府、县，命达鲁花赤（督官）72人镇守，大军撤出高丽。第二年六月，高丽王举反，杀死蒙古所置达鲁花赤72人，迁都江华岛。于是，窝阔台决定第二次讨伐高丽。八月，再命撒礼塔率师征高丽，至王京南，攻其处仁城时，中流矢亡。副帅铁哥领蒙古军回师。原降服的高丽百姓归由洪福源统治。十月，高丽王遣其将军金宝鼎、郎中赵瑞章向窝阔台上书请罪。1233年四月，窝阔台诏谕高丽王悔过，并指出他犯下的五大罪状。高丽王因占据江华岛，而蒙古无水兵，故不从命朝觐。反而又派兵攻陷已归附于蒙古的西京等处，劫夺了降将洪福源的家。为此，窝阔台决定第三次派兵讨伐高丽。
1235年春，窝阔台命唐古再征高丽，至1237年先后占领龙冈、咸从等余城。高丽王请降，但不亲赴朝觐，只遣使入朝。蒙古则一再促其还都陆上，履约朝觐，然高丽王总是拖延不动。因此，1240年蒙古又派兵攻克昌州、朔州等地。1241年高丽王以族子为己子入质，高丽又臣服于蒙古.
蒙古的这一系列战争,除了攻打金国之外,黑龙江统统都没有直接参与.只是在和南宋交恶的时候,前线将领得到了郭进的属托,没有进行大规模的烧杀抢掠~~~