华佗也算倒了霉，曹操病逝的这天他又正好在曹操身边，曹操突然的倒地，之后就是鼻血长流，用尽了法子都止不住，鲜血湿透了十余条毛巾，未过多久竟然逝去。其实后来才发现曹操这时何止鼻孔在流血，他死前七窍都在流血。这是一种晚期病症，最后得不到控制血崩的现象，实属正常。但曹丕伏在曹操尸身上痛哭，谁劝也不听，作为今侍在侧的华佗正为小主公曹丕着急之时，不合时宜的进言劝了曹丕一句。这就引起了曹丕的注意，他立时拔下房内臂上的长剑，一路追着华佗要他给父亲陪葬。
后来曹洪等及时劝下了曹丕，但曹丕三不罢四不休，一定要拿华佗问罪。拗不过曹丕的曹洪、曹纯后来也就顺曹丕之意，把华佗逮捕，下了大狱，准备在曹操大殓时，血祭了他。一个郎中的生死，医术再高超，在曹洪、曹纯这些人眼里，都不算什么。
之后，也有无人问津这位旷世神医的命运，直到在商议曹操丧事各项事宜上，曹洪就提到了准备被血祭的华佗，曹智才得知华佗已被下狱一事。
曹智对把责任怪罪在华佗身上，很是不赞同。华佗虽说在后世被称为神医，但他毕竟人，而不是神仙，那有能保证人不死的。再说曹智振振有词的对曹洪等人明言，要给曹操当祭品的不是可怜的华佗，而是吕布、陈宫之流。他们接下来最大的任务就是早日拿下吕布、陈宫之流，因为曹操的死和他们的叛乱是分不开关系的，不是他们曹操也不会受重伤，而引发多年的顽疾彻底失控，最后殒命。
曹智的这一表态，让曹洪等人感到羞愧，而曹智在曹氏一族，或是朝廷的声望却更进一步。不以妄杀蝼蚁为荣，却以报父兄之仇为己任，这无论如何都是会引起别人尊重的。
曹智把华佗接出了监狱，并带往许昌，推荐给了献帝，入了太医院，成为一名有官衔的医生。
华佗两世为人，从差点被凌迟，到成为一名太医，真是感慨自己人生的坎坷。对曹智的及时搭救，和举荐感激涕零的发誓今生今世效忠曹智。
其实华佗还是很愿意做官的，不像后世一直描述的他是如何如何超凡脱俗，不愿沾染红尘之中朱门酒肉臭的超凡之士。古代“且耻以医见业”的对医生这个行业的定性，使很多人对医生、郎中这个行业望而却步。华佗也在年轻时，想过要出仕为官的理想。华佗更是在年轻时通晓数经，是个非常有才能，很年轻有为的年轻俊杰。曾被沛相陈珪（陈登的父亲）举为孝廉，太尉黄婉亦曾辟他为幕宾。
但不得不说华佗的官运一直很是不济，想找个大靠山，待价而沽，有一番作为，却一直未能如愿，最后机缘巧合之下，就让他走上了医道，并做的很是有成就。
华佗能碰到曹智也算人过中年后的一大机遇，曹智不但很是信任与他，还让他圆了大半生的出仕为官梦想，虽说这个官职只不过是一个太医，但这已经代表了华佗医学领域的最高成就。
到了许昌之后，曹智已是无暇再过多接见华佗，因为各种事物缠身的他，整日要处理很多国事，及积极的投身为这个分崩离析的旧国，制定新的国策，以期待带来转机。
曹智扶曹操灵柩回到许昌，入葬东郊皇陵区后，就迎来了多个好消息，首先是张邈的首级被张邈的属下送到许昌。兖州叛乱张邈也算首恶之一，这下曹操的祭品倒是不缺了。
张邈是在跟谁吕布等人逃亡徐州的路上，左思右想，觉得跟着吕布、陈宫是没出头之日了。张邈失了地盘，带到吕布这儿的兵马又不多，早就不受吕布待见。于是张邈决定转道去豫州，投奔老兄弟袁术。张邈考虑到他和袁术关系不错，上次屯兵封丘的情分还在，到袁术那儿应该是个不错的选择。
但当张邈的千余部下护卫着他入豫州后，才发现，曹军早在那，大半个豫州也已经不姓袁了，而早已是曹军的地盘。恐慌之下，张邈的部下，立时发生了叛变，杀了张邈，捧着他的首级投降了曹军。张邈就这样死了，死的很是默默无闻。
曹智在收到张邈首级的这一天，并没有表现出多大的兴奋。毕竟他和张邈认识十几年，感情也一直不错，没想到他今天的首级就这样放在了他的面前。如果此时曹操还能大声笑出来，那他可真不是人了。
但再怎么说，张邈最后的人生走错了方向，成了曹操、曹智的敌人。对待敌人的首级只能成为祭奠亡兄的一种工具，而对于反叛张邈的部下，曹智也没有特别重赏，只是和收编了他们，让他们成为自己军中的一员。
接下来就是前线传回捷报，在于禁、郭嘉、徐晃等曹军文武同心之下，曹军前锋一到颍川，就在徐晃的率领下，大败黄巾军，贼首何仪被徐晃斩杀，刘辟在连失数城后，迫于曹军的强大，只得投降。
曹智对于这份战果还是满意的，立即升任于禁为振武将军，郭嘉拜他为军事祭酒，成为曹智帐下参谋军事之官的第一人。徐晃升任为平寇将军，投奔曹智没多少时日，就有了兵权，可见曹智用人不疑疑人不用的一贯作风，和对徐晃的信任。
拿下颍川后，曹智挟天子实际控制的地域已不仅仅是兖、杨两州了，从司隶的河东、河南、河内到豫州的颍川、汝南到兖州，南到临海的地域，最远道现今的台湾，都已成了曹智的地盘。而盛及一时的袁术，现在差不多被曹智辖制在一半豫州和大半个九江这块地域里，并形成了包围。
但袁术这个袁氏的嫡传，却在这种形势下，脑子越来越不清醒，正积极准备着他的称帝事宜。袁术一直认为袁姓出自于陈，陈是舜之后，以土承火，得应运之次。又以为谶文云：“代汉者，当涂高也。”说的就是自已，故袁术获得玉玺后，一直梦想自己成为皇帝。
等到建安二年时，他实在等不及了，即于寿春称帝，自诩为天子，建号仲氏，广置公卿，像模像样的设置朝廷机构，祠南北郊。
袁术称天子的行为，直接惹来天下人的反感。首先是孙策在江东正式公开脱离袁术而自立，逐走袁术任命的袁胤等人，吴景、孙贲等隶属袁术的官员、大将，也纷纷倒戈他，正式加入孙策阵营。
此时，曹智刚挟天子以令诸侯，袁术的行为等于否定了曹操手上的天子正统地位。曹智首先让献帝发诏，先天下公开定性袁术为反贼，要求各路诸侯讨伐。袁术很快成为了众矢之的，不久就接连遭到多方的叛盟与打击。
但在还没人打他之前，称了帝的袁术生活开始急剧奢侈荒淫，横征暴敛，使江淮地区残破不堪，民多饥死，部众离心。
曹智在准备出兵讨伐袁术之前，先采用政治上联合多方打压袁术的方法，并且自己并不急着出兵，先采取观望一段时间的策略。
因为曹智在这一段时间的扩张后，也的确需要修养生息一段时日。连年的征战和迎帝，曹操的突然故去等一系列事，都不但让曹智心力交瘁。他需要喘口气，理一理思路，他的属下，他的兵马同样需要。于是曹智决定在这段时间里暂且罢兵，在巩固现有地盘的同时，积极开始未来发展的国策。
通过连年的战乱，当时的社会生产遭受严重破坏，出现一点天灾，就会导致很严重的大饥荒。这一时期，粮食供应成为各军事集团最大的问题，因军粮不足而无敌自破者不可胜数。
建安二年新春刚过，曹操就要荀彧以他尚书令的职权，召集朝廷四十几名官员讨论未来治国若干建议。曹智的扬州，曹操的兖州，在去年实行下的屯田制，效果明显，去年的收成相当好，得谷百万斛。现在曹智治下的军粮供应稳定，养活自己和曹操遗留下来的数十万军队，在未来一年之内，基本不成问题。并根据毛玠的统计，以目前的储备，曹军在今年完全可以发动一场大规模战役之需。
既然这个政策实施效果很好，曹智建议继续采纳这一屯田政策，并要在现有的土地上全面推广。之后并有以献帝名义颁布命令的方式，正式在现有的各州郡设置田官，兴办屯田。
在兴置屯田的同时，曹智采纳各种措施，扶植自耕农经济。针对当时人口流失，田地荒芜的情况，曹智先后采取招怀流民、迁徙人口、劝课农桑、兴修水利、检括户籍等办法，充实编户，恢复农业生产。作为现代户籍民警出身的曹智，在重新修订户籍制度时，提出了很多有建设性的意见。此外，曹智还陆续以献帝的名义颁布法令，恢复正常租调制度，防止豪强兼并小农。