沈有容满以为一炮干沉了指挥舰，西班牙的战船就会失去指挥，然后自己在指挥舰队撒网一捕，聚而歼之，这场仗就算是打胜了。但是没有想到这些西班牙人不像那些小国的军队，一旦失去指挥就会成鸟兽散，现在整个战场已经一个菜市场，明军战舰已经不能再接受指挥了，因为西班牙的战舰还在纠结之中，根本就没有听从指挥的条件。刚刚干掉对方指挥舰还在高兴的沈有容很快就笑不出来了，因为他的全盘部署已经因为西班牙指挥舰的沉没而被打乱了：正面的宝船正在疲于应付周围的西班牙战船，那护卫的两百艘主力舰也因为激烈的战斗而乱了套，都在攻击眼前的西班牙战舰，而迂回到后面的明军战舰则遇到了大批的正在想着脱离战斗的西班牙战舰，那些想要攻击的补给船则早就因为战场大乱而自己没有强大的火力而退出了，结果迂回的明军没有达到补给船，却遇到了想撤出的西班牙战舰，两方二话不说，就开始了大战，整个战场上已经没有了队形，只有敌我双方的炮弹在乱飞。
沈有容见到这种情况，马上指挥自己的宝船，尽量轰击着正在主动集结的西班牙战船，宝船凶猛的火力击散了正在集结地几群西班牙战船，可是更多的西班牙战船正在集结，还有渐渐组成新的队形的意图。原来指挥舰被击沉之后，西班牙的副司令波拉微接替了指挥，正在拼命集结队形准备继续围攻宝船，沈有容虽然尽全力轰击正在集结地西班牙战船，可是战斗刚刚开始，西班牙战船还没有受到严重的损失，所以慢慢的柏拉维集结起了大部分的西班牙战船，并重新开始对宝船开始围攻。西班牙战船集结起来了，沈有容也集结起了明军的战船，一场混战之后，双方重新开始大战。这一次沈有容改变了战法，为了不再出现混乱，沈有容下令舰队排成一字长蛇阵，从左至右将西班牙战船完全拦截在自己的面前，并且开始齐射，牢牢地将西班牙战船拦截在自己的前面，以宝船为中心，发动攻击，等待迂回的明军从后面发动攻击，双方你来我往在海面上展开了激烈的炮战，互相各有损失，这个时候，与会的明军水师从后面赶过来了，从后面来的明军也是一字长蛇阵，并且从左边到右边围成一个大圈，首尾相接将西班牙水师围了起来。
沈有容见到与会的明军赶到了，并且和自己的正面水师一起将西班牙水师围了起来，但是西班牙战舰并没有像沈有容想的那样开始突围，而是舰队以三艘船为一队，组成了一个个的三角队形，围着圈用排炮轰击明军的战舰，而西班牙舰队的后面则组成了一个有百余条船组成的大三角队型，开始攻击后面的明军战舰，西班牙队形的变换，使西班牙军后面破开了明军的包围，并开始进行突围。
沈右荣见状马上命令作为预备队的，特就是比西班牙舰队多了的那五百艘战舰出击，在西班牙舰队刚刚突破包围圈的时候，并压了上去，双方在突破口的方向上与西班牙人陷入混战！沈有容见对方的大部队还在包围圈内的时候，马上命令宝船出击，从正面杀进去开始攻击西班牙的战舰。但巨大的宝船杀进西班牙舰队的时候，西班牙舰队就开始围攻宝船，可是宝船皮糙肉厚，火力凶猛，不停地开着炮，西班牙军见围攻吃亏，便将宝船围起来，开始了轮流开炮。可是外面的上千艘明军战舰仍然在攻击，外面的西班牙战船看准了明军船只为了包围自己而变的兵力分散，便开始了进攻，用几条船攻击一条大明船。明军也开始针锋相对，集合了数条船开始对抗西班牙战船的围攻，这样，沈有容的战船拖住了大部分的西班牙战船，使外面的明朝战舰更加突出了数量的优势，
就在沈有容大战西班牙战船的时候，明军的放火船也开始攻击西班牙的补给船，西班牙的补给船很大，比战舰还要大，单是火力就不行了
，再加上明军放火船的小巧灵活，西班牙的补给船几乎没有还手的能力，熊熊的大火很快使西班牙的补给船烧成了一个个的火把，烧掉西班牙的补给船之后放火船马上回军，参加对西班牙主力舰队的围攻。这个时候正面战场的西班牙船依然在用三角阵型滚动着开炮，并努力在突围，而明军战舰则在死死地将其围住。西班牙副统帅见这样一直对轰并消耗下去，自己在兵力不占优势的情况下是很吃亏的，所以他下令集中了百余条主力战舰向西冲锋并且以最大火力轰击明军战船。
上百条的西班牙战舰很快集中起来向着西方突围，明军的包围圈虽然形成，可是由于包围圈太大，全仰仗宝船在敌群中横冲直撞破坏西班牙战船的集中和突围，可是现在有三分之一的西班牙战船在围攻宝船，虽然有其他主力战舰的掩护和帮助，但是还要维护包围圈不让西班牙战船逃跑，所以和宝船一起作战的主力舰并不多，并不能全部打乱西班牙战舰的集中，西班牙人抓住这个机会，将上百条的战舰集中起来，向西突围并且用上百条战舰的火力取得了局部的优势，成功地将包围圈撕开了口子。包围圈的破裂使得大批的西班牙战船突出重围，开始逃窜。逃出包围圈的西班牙战船还没有来得及高兴，就发现西面的海面上出现了大批的小船，随着距离的接近，西班牙人看清了，那是明军的船，也就是烧掉了补给船回军的明军放火船。从这些船来的方向上看，西班牙的副统帅当时就明白自己的补给船凶多吉少。
郁闷的西班牙人只好再次准备迎战，但是当他们遇到明军放火船的时候，沈有容也见西班牙战船突围而去，也开始变换队形，把包围圈两翼的明军战船排成纵向编队，按照西班牙人逃跑的方向实施两翼追击，逃出的西班牙船在遇到了明军放火船之后，不得已与之展开战斗，这样就拖住了逃跑的速度，使明军的主力战舰再一次与会过来将其重新包围。西班牙战舰的副统帅见马上又要被包围，立刻下令使用战船上的撞角冲击明军战舰，努力破坏明军的包围，这招还是发挥了作用，几艘甚至几十艘的西班牙战舰排成队撞了过来，很多没有来得及躲闪的明军战舰被撞中，两方的水兵马上开始了近战。这样，西班牙的战舰成功的破坏了明军的包围圈，两军霎时陷入了混战！双方没有了指挥，也没有了阵型，只有想消灭对方的想法，每一条战船都在努力击沉自己眼前的敌对战船，海面上枪来炮往，一片腥风血雨，这个时候的西班牙统帅也明白，补给船被击沉了，就算突围出去，也无法回到西班牙的殖民地，而这里全市荷兰船和明军战船，这种情况下就只剩下了击败对方这一件事了！
看到因为西班牙战舰的撞击而没有形成包围圈，沈有容气的大怒，可是却没有办法，只好也率领宝船再战场上见西班牙的船就开炮，不断的击沉西班牙的战船，而自己的战船也被东一炮西一炮不断地被击中，虽然都是小伤，可是加上这个混乱的战场，沈有容觉得自己这场仗打得实在是憋屈，不住的大骂。但是这种情况持续了三个多时辰之后，明军仗着比西班牙战舰多了五百艘主力舰，再加上到处放火的明军小船，西班牙舰队渐渐的落了下风，明军舰只占了多数，开始了对西班牙战舰的最后围剿，沈有容也总算是松了一口气。沈有容看着最后的几百艘西班牙战船，下令全部击沉，不接受投降！明军舰队将这几百艘西班牙战船围起来，用排炮进行硬性消灭，最后西班牙战船被全部消灭了，可是沈有容却从这一仗发现了西方军队和东方军队的不一样的地方。