不管申若愚在这里依靠各种设备专心寻找上帝沉睡的庇护所，外界却因为申若愚替代了上帝的存在而产生了巨大的反应，并且因为各种神话生物的频频出现导致了外界对于上帝和各种科学的怀疑，再加上申若愚暗地里安排了许多人，将许多即将出现或者已经出现的一些著名科学家给秘密的通过各种手段带回了自己的基地导致了科学发展的停滞，虽然这样一来引起了一些国家的怀疑，但是在申若愚远超这个时代的科技之下找不到任何的线索，而教皇保罗四世最近则很是意气风发，因为众多天使的加盟导致了现在教廷的实力和信徒急剧膨胀。
各地都出现了大量的教堂，而且教廷内部的武装势力，包括裁判所和圣殿骑士团以及最新组建的直属教皇的圣堂武士，在天使和申若愚提供的各种提升身体素质的基因药剂的支持之下更是实力膨胀的厉害，这样一来教廷在欧洲范围内的话语权也越来越大，虽然一些国家也在暗中支持了许多组织与教廷对抗，但是却因为实力的差距太大最后都惨淡收场
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最后在英国女王的牵头下联合了法国和西班牙以及葡萄牙和意大利等受到教廷一些好处和条件的国家组成了支持教廷的神圣联盟，而以美国和德国还有匈牙利还有加拿大等除神圣联盟之外的国家则组成了反对教廷的真理联盟。
于是两个联盟之间便开始了各种明争暗斗，但是因为各种神话生物的作乱，真理联盟很大的一部分实力都被这些生物给牵制住了。所以从一开始就处在了下风。并且由于各种原因和天使本身所代表的意义以及本身的实力。再加上这些国家内部许多人也都是信仰教廷的，所以内部也不得不允许各大教堂的继续存在和天使的出现，只是在其强大的武力支持下暂时保持一种平稳而已。
而在天使联盟内部，由于有申若愚的支持许多在各地“作乱”的恶魔和各种武力强大的神话生物，则在各种众目睽睽之下不是被天使赶走就是被圣堂武士或者圣殿骑士团给一一消灭，因此教廷的声望在民众中的声望变得越来越受欢迎，再加上教廷一改中世纪时期的各种强制传教，转而变得温和许多。并在各地和一些偏远贫穷的地方开办了许多的神学院和武士学校，免费接收那些上不起学或者因为各种状况而变成孤儿的孩子开始从小培养，而且还开办了许多的教会的医院，免费为那些交不起医药费的穷人看病，因此在神圣联盟内部出现了极为和谐的情况，两相对比之下，再加上一些潜藏在真理联盟内的特务进行的一些宣传，真理联盟内部的一些民众纷纷通过各种手段和神圣联盟特工的帮助下逃到了神圣联盟内部，并且得到了十分妥善的接待和安排。
而那些被神圣联盟“赶走”的神话生物则纷纷进入到了真理联盟的内部，这下子真理联盟原本就十分紧张的局势和内部矛盾一时变得更加糟糕。一些小国家迫于民众的压力不得不暗中联系了神圣联盟请求教廷派一些天使或者圣堂武士来消灭这些恶魔！
而美国，加拿大和德国等比较有实力的国家虽然也利用强大的武装军队。杀死了一些不太厉害的恶魔和小怪物，但是自身受到的损失也是不小，而且凭借着现在的武装力量，一些特为强大或者神秘的生物和恶魔根本就不惧怕现在的各种枪械和武器，在损失了无数的军队和特战队之后，在真理联盟之内形成了许多被怪物霸占的禁地，好在这些恶魔和怪物也并没有无故的残杀人类，这些实力突出的恶魔和怪物明显在智力上也极为出色，而在对抗中这些国家倒也出现了一些依附于真理联盟拥有神奇力量的人士，虽然数量不多但是倒也勉强能够保证一些重要城市的安全。
时间就在神圣联盟和真理联盟的明争暗斗中慢慢过去，不过为了不爆发范围过于广大的战争，教皇保罗四世在申若愚的指示下并没有采取过激的行动，而是采用蚕食的政策慢慢的对真理联盟进行软侵略。
三年之后，真理联盟的成员只剩下了美国，加拿大以及德国三大国家，其他那些小国家则在这两年里纷纷投入到了神圣联盟的怀抱。
这三年里申若愚得到了教廷内部几百年来的全部珍藏，其中确实有许多值得借鉴的东西和书籍，并且还找到了传说中的死海文书，以及许多关于玛雅文化和古华夏的各种文献，再搭配上之前找到的亡灵黑经和太阳金经，申若愚在信仰之力的运用之上确实得到了长足的进步，并且初步解决了利用信仰之力不通过申若愚本身处理就将其返还给信徒形成各种神术的方法。
但是这一切的前提就是申若愚必须拥有神格，而因为不想凝聚神格，害怕因此而被神格和信仰之力给限制住自己本身的发展以及未来，但是因为许多事情和能力却偏偏需要神格的帮助和处理，所以这三年申若愚在盘古的帮助下想到了一个代替神格的办法，那就是盘古牺牲自己的大部分能力通过信仰之力的神奇作用进行洗刷，尽可能的缩小自己本身的体积，进而做了一个小手术放入到了他的大脑之内，使之与申若愚的神经进行连接，之后将所有的信仰之力全部凝结在盘古所化的芯片之上，以盘古为核心，形成一个有自身处理能力的高科技神格
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这样一来有盘古的存在，神格对于申若愚来说就成为了一个功能强大的处理核心，并不需要任何事情都通过申若愚自身的处理，而且这样一来即使将来信徒全部死去信仰崩溃，申若愚也不会因此而受到牵连，大不了将盘古的程序复制一下，转移到一个新的超级处理核心之内就好了，至于因此而崩溃的神格，因为并没有依附在申若愚的灵魂之上，到时候崩溃的就只可能是神格本身，到时候申若愚只要再在一些世界内重新布下信仰就可以再次依靠盘古凝结新的神格了！
再说申若愚本身就拥有一个世界，这个世界内的全部生物都是申若愚的天生信徒，而且还都是狂信徒，信仰基本上不可能崩溃，这样做只是申若愚处于自身过于谨慎的性格而已！
而完全忠于申若愚，又曾经吸收了火种源的盘古在制定了这个计划之后，就尽全力制造了一个替代自己的高智能智脑代替自己的日常管理和各种工作，然后就全身心地投入到了这项芯片神格的准备工作之中，而经过近乎一年的信仰之力冲刷，盘古本身所化的芯片基本上已经处于了一种物质和能量体之间的一种神奇物质，而曾经吸收的火种能量不但可以叫申若愚得到类似于人类这种碳基因生物的信仰，就连变形金刚这种硅基生命的信仰之力也一样能够接收，这样一来申若愚的信仰传播范围可就大了一倍，而且他还能通过盘古依靠硅基生命的信仰之力逐步提高变形金刚的智能和能力，也算是一大收获吧！
于是在四年后的某一天，教皇宣告再次收到神谕，得到了只要信仰虔诚，然后通过教廷内部教导的手势和语言就能放出一部分神术，其中最为著名的就是圣疗等一些作用广泛的治疗技能！
至于其他一些关于战斗和辅助的神术，就只能在教廷内部的各大武装力量里流传了，而那些治疗技能也只有那些拥有正式教廷内部人员的神父和修女才能得到，而且就算是教廷宣布了几个作用不大只能治疗一些外伤的小光疗术的手势和咒语，一般的信徒也完全做不出来，只有那些信仰极为虔诚的狂信徒才能用出来，这样一来教廷正好可以凭借这个办法来吸收那些信仰虔诚的信徒成为核心，杜绝了各种间谍和特务的出现！
而神术的出现彻底击垮了已经只是勉力支持的真理联盟，通过各种外交手段和申若愚手下那无孔不入的本事，在第五年的元旦也就是一月一日，真理联盟宣布正式并入神圣联盟，至此美洲和欧洲以及大洋洲大部分地区正式成为了神圣联盟的地盘，除了亚洲之外整个地球全部成为了申若愚的信仰之地。
而在亚洲的华夏，印度，以及阿拉伯地区也出现了一个名为紫霄神教的组织，并且开始以一个极为惊人的速度逐渐占据了亚洲以及亚洲周边的大部分地区，并且在教廷暧昧的态度之下成为了全球第二大的宗教组织，如果有心的话人们会发现两个宗教的信仰神袛有些惊人的相似。
而整个世界的格局在两大宗教组织的有心引导之下，科学技术虽然还在发展，但是其主要发展方向基本上放弃了武器以及战争方向的发展，转而全力针对各种民用技术，而在神术的支持之下，各种火器的作用被减小到了一种只是辅助的作用，各种神圣武士和圣堂武士以及专攻进攻性神术的神父逐渐占据了各国武装力量的大部分份额，火器就成为了维持地方治安的警察的主要武器！而各种魔兽骑士和龙骑士也成为了各国的尖端力量，整个世界在某种程度上成为了曾经人们印象中的神话时代，并且还以此为发展方向，走向了一条另类的发展路线。