次日，朱由检下了早朝，起驾东厂。
东厂，即东缉事厂，大明特权监察机构、特务机关和秘密警察机关。成祖朱棣于永乐十八年(1420年)设立东缉事厂(简称东厂)，由亲信宦官担任首领。地点位于京师东安门之北。 后来，锦衣卫与东西厂并列，活动加强，常合称为"厂卫"。 东厂权力在锦衣卫之上，只对皇帝负责，不经司法机关批准，可随意监督缉拿臣民。
东厂的首领称为东厂掌印太监也称厂公或督主，是宦官中仅次于司礼监掌印太监的第二号人物。通常由司礼监中排名第二或者第三的秉笔太监担任，其官衔全称为"钦差总督东厂官校办事太监"，简称"提督东厂"。现在当然是外出抓人抄家的魏忠贤担任。
东厂的属官有掌刑千户、理刑百户各一员，由锦衣卫千户、百户来担任，称贴刑官。除此以外，设掌班、领班、司房四十多人，由锦衣卫拨给，分为子丑寅卯十二颗，颗管事戴圆帽，着皂靴，穿褐衫。其余的人靴帽相同，但穿直身。
具体负责侦缉工作的是役长和番役，役长相当于小队长，又叫"档头"，共有一百多人，也分子丑寅卯十二颗，一律戴尖帽，着白皮靴，穿褐色衣服，系小绦。役长各统帅番役数名，番役又叫"番子"，又叫"干事"，这些人也是由锦衣卫中挑选的精干分子组成。
东厂不仅在机构及人员配置上精干合理，而且在侦缉行动上制订了相当严密的制度。如每月初一东厂都要集中布置当月的侦缉工作，厂役在东厂内抽签决定所负责的地盘。在文献记载中可以发现，东厂厂役的工作种类都有特殊的名称。例如监视朝中各部官员会审大狱及锦衣卫拷讯罪犯者名为"听记"，在各处地方官府访缉者名为"坐记"，还有某位官员有何举措，或某城门捕得要犯，胥吏记录上报东厂者名为"打事件"。
东厂的职能是"访谋逆妖言大奸恶等，与锦衣卫均权势"。一人掌理，委以缉访刺探的大权。起初东厂只负责侦缉、抓人，并没有审讯犯人的权利，抓住的嫌疑犯要交给锦衣卫北镇抚司审理;但到了明末，东厂也有了自己的监狱。
很多穿越者都会在这里改革一下，搞出一个三权分立，取消东厂的审讯、关押权力，而交由大理寺、刑部等，看起来很有道理，但是“三权分立”说得好听，其实不过是互相掣肘，如果要想监控其是否违法违规，不过是派几个密探、卧底而已。
东厂的侦缉范围非常广:一、朝廷会审大案、锦衣卫北镇抚司拷问重犯，东厂都要派人听审。二、朝廷的各个衙门都有东厂人员坐班，监视官员们的一举一动。
东厂监视政府官员、社会名流、学者等各种政治力量，并有权将监视结果直接向皇帝汇报。依据监视得到的情报，对于那些地位较低的政治反对派，不经司法审判，东厂可以直接逮捕、审讯;而对于担任政府高级官员或者有皇室贵族身份的反对派，东厂在得到皇帝的授权后也能够对其执行逮捕、审讯。
东厂入内即摆设大幅岳飞画像，提醒东厂缇骑办案毋枉毋纵。
这些都是很好的制度，朱由检自然不会画蛇添足，他也不会在魏忠贤还在外面给他卖命时，就对东厂大动手术。没有必要，而且得不偿失。朱由检绝对不会明摆着做出激怒某些利益集团的事的，黑锅一定要别人背，他作为大明皇帝，只需要不时施之以恩德、收买人心就可以了。
就像资本家为了更好剥削无产阶级，总是会雇佣职业经理人，让他去管理，这样所有的矛头都会指向管理层，而不是资本家自己。内卷才是资本家喜闻乐见的。
所以，朱由检只是重申了一下东厂的原则、目的、机构文化，画一下大饼，然后让他们为完善或者说改善目前的情况献言建策。这样就可以转移矛盾了，冤有头债有主，要怪就怪出主意的人啊！当然，朱由检可不会玩卸磨杀驴这一套，这么好用的靶子、智囊当然要人尽其才！又提拔了几个有真才实干的人才，把一些无能之辈丢去进修，到时由他亲自考试，通过后再委以重任。
这样，朱由检就基本掌握了东厂。
这时候已经没有西厂了，所以朱由检从东厂出来，就摆驾锦衣卫。
锦衣卫是大明军政搜集情报机构，前身为太祖朱元璋设立的"拱卫司"，后改称"亲军都尉府"，统辖仪鸾司，掌管皇帝仪仗和侍卫。洪武十五年(1382年)，裁撤亲军都尉府与仪鸾司，改置锦衣卫。
作为皇帝侍卫的军事机构，锦衣卫主要职能为"掌直驾侍卫、巡查缉捕"， 从事侦察、逮捕、审问等活动。也有参与收集军情、策反敌将的工作，如在万历朝鲜战争中收集了大量的日军军情。
所以朱由检来锦衣卫做的，基本和东厂一样。
除此之外，朱由检特意让他们挑选善于随机应变的加以培训，然后派往野猪皮那里，收集情报、离间、策反他们。
锦衣卫首领称为锦衣卫指挥使，一般由皇帝的亲信武将担任，直接向皇帝负责。可以逮捕任何人，包括皇亲国戚，并进行不公开的审讯。这里，朱由检也不打算更改，用后世码农血泪经验来说，就是如果一个程序能跑，哪怕没有腿，如果你不理解，那就不要随便改动它！
锦衣卫首先是皇帝的侍卫亲军和仪仗队，由将军、校尉和力士组成。将军初名"天武"，永乐时改称"大汉将军"，选取体貌雄伟、有勇力者充任，作为殿廷卫士。校尉、力士拣选民间身体健康、没有前科的男子充任，校尉掌管卤簿、伞盖，力士举持金鼓、旗帜。
平日里没有朝会活动时，各卫亲军分别值守皇城四门，唯独锦衣卫将军在午门外昼夜守卫，总共100人。午门是宫城的正门，可见锦衣卫地位之高。
皇帝在奉天门御门听政的时候，锦衣卫堂上官一员侍立在御座西侧，负责传旨。锦衣卫将军一百二十九人与千户二人、百户四人，分别守护在丹陛、御道、金水桥以及奉天门广场的各个门前。此外还有锦衣卫校尉五百人，排列在午门内外，负责鸣鞭及执掌仪仗。
每年正旦、冬至、万寿节三大朝会，锦衣卫与其他亲军一起承担侍卫和仪仗职责。仪仗队伍共有四千人余人，其中锦衣卫多达一千五百人。朝会期间距离皇帝最近的就是锦衣卫，随时侍奉左右，听候调遣。
每当皇帝因祭祀或巡游而出宫时，锦衣卫也要在驾前扈从。他们有的负责沿途巡视，有的负责在銮跸与京城之间传报消息，有的在驾旁侍骑，传奏御辇的起落。
所以为了安全起见，朱由检还加重一套奖赏制度，对于那些能够及时发现威胁、异常的予以奖励。并给所有小旗及以上官员配发望远镜。
"巡查缉捕"是锦衣卫区别于其他各朝禁卫军的特殊之处，负责侦缉刑事的锦衣卫机构是南、北镇抚司，其中北镇抚司是洪武十五年添设，专理皇帝钦定案件。成化元年，增铸北镇抚司印信，一切刑狱不必关白本卫。北镇抚司拥有自己的诏狱，可以自行逮捕、刑讯、处决，不必经过一般司法机构。
南、北镇抚司下设五个卫所，其统领官称为千户、百户、总旗、小旗，普通军士称为校尉、力士。
作为皇帝的贴身卫队，为了保证皇帝的安全，锦衣卫必须防患于未然。他们于是时时出动，刺探可能威胁皇权、危害朝廷的行为和言论，并捉捕和审讯嫌疑人。他们的这项任务被皇帝特许，并逐渐演变为军事特务的职能。
鉴于此，朱由检特意强调了让他们想办法提高专业素质，增加效率。
洪武时期，因为锦衣卫有非法凌辱、虐待囚犯的行为，朱元璋下诏焚毁锦衣卫刑具，废除了他们的这项职能。成祖朱棣登基之后，恢复了锦衣卫的所有权力，并有所加强。他设置了北镇抚司，专理"诏狱"，可以直接逮捕和拷问犯人，刑部、大理寺、都察院这些司法机关无权过问。宪宗成化年间又增铸了北镇抚司印信，一切刑狱专呈皇帝，毋须通过指挥使转达，使锦衣卫北镇抚司成为皇帝直辖的司法机构，权力达到极致。负责侦察、缉捕的锦衣卫官校称为"缇骑"。由于权力缺乏限制，他们为了邀功请赏而罗织罪名，不择手段地扩大牵连范围，制造的冤假错案不胜枚举。
对此，朱由检除了另派卧底、监察，也没什么办法，不过他是皇帝，自然不需要自己想办法，于是仍然令人献计献策，择其善者而从之，进一步完善了锦衣卫。
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