由于明李控制了九江附近地区，战船在江西鄱阳湖和赣江上具有了无可置疑的制湖权和制江权，因此江西的许多物产也都不由自主地想九江地区集合。
对明李政权影响比较大的是木材，这些木材不少都是已经经过两年以上晾干的木材。本来是被闽浙订下打算制造船只所用的。由于满清迁界禁海，这些订单全被明李吃下，顺便压价。
上好的木料被李军运送到南京作为打造战船的材料。其他不适合打造战船的木材，则按照李存真所绘制的图形制作成了两百多个木牌水城，大约每个木牌水城能够容纳两百到三百人不等。木城内可以使用火枪、大抬枪和轻型火炮，也能够为士兵提供休息场所。
有的木牌水城，几个之间用铁索相连，漂浮在长江之上，作为防御上游大规模水军之用。还有的木牌水城可以组合在一起，或是拼接或是使用铁链捆绑，便能够组成庞大的水上要塞。
李存真非常了解后世太平天国革命运动失败的技术性原因之一就是天平军在十几年的时间内一直也没有掌握长江的制江权。
这导致湘军和其他清军能够在长江南北来回穿插，甚至在南京附近地区，在洪秀全的眼皮子底下建立起江南、江北两座大营，用以围困天平军。
李存真命令淮西军和驻守在九江地区由白驹率领的近卫军一部多多打造木牌水城，用以防止清军在长江、赣江等水上来回流窜。
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永历十四年下半年到永历十五年三月，明李南京火器制造在保罗的不懈努力之下，竟然打造了六千杆新式南洋火枪。
新型的南洋火枪，彻底抛弃了李存真此前在南洋当海盗时候使用的德尔文机制，用钢芯棒抵住弹丸，暴力捶打使弹丸变形契合膛线的原理。
转而采取了保罗儿子黑尔的设计，利用热胀冷缩原理制造膨胀，使子弹契合膛线，旋转发射。其实就是原本历史发展当中的米涅子弹。和米涅步枪不同的是，发火仍然使用燧发式而不是火帽发火。由于使用定装纸壳弹，去掉了簧轮，利用苏钢做簧片和火镰，新火枪的发火律能够达到八成半。
制造出来的新式火枪射程远，能够达到一百八十米，而且十分精准，杀伤力惊人。但是，由于十七世纪的冶金技术还不如十八、十九世纪，所以南明新式火枪在打了三百发子弹后，枪管内部的膛线由于磨损、热胀冷缩等原因而变形。变形便会出现空隙，密闭不严，子弹动能失去很大一部分，初速降低且在枪管内来回乱动，因此和滑膛枪也差不多了。
由于有膛线，反而比滑膛枪更加容易炸膛。所以，损坏的枪管便需要重新铸造，这增加了南洋火枪的成本。
由于训练和实弹射击消耗了部分火枪，因此新式南洋火枪不过只有五千杆而已。
因为有了水力轧机，有了螺杆和镗床，燧发火铳的数量大幅度提升，目前已经制造出一万杆并装备部队了。
李存真来自后世，知道簧片和发火之间的关系，用了更好的钢材，目前是苏钢，因此燧发枪的发火率远远高于新式南洋火枪能够达到九成。也超过同一时期法国、英国和瑞士等国的燧发枪，成为世界领先技术。
不论是南洋火枪还是燧发火枪，不少都配备了卡座式刺刀。刺刀百分之五十都是手工打造的，机器打造的仅仅百分之二十。南明现在还不能实现全机械生产，精密程度没有达到生产线要求的那种水平。
主要原因就是因为枪管粗细不同。南洋火枪的枪管要更粗一些，枪管管壁也更厚一些。而燧发滑膛枪枪管就要细一些了。而且即便是滑膛枪，每个的枪管粗细也有细微差别，所以套不上卡座式刺刀。
大明的精细加工可能还需要至少五年的打磨时间，才能做到标准化和制式化。
此外其余的百分之三十是使用的插管式刺刀，也就是把刺刀的刀柄直接插在枪管中，稍一旋转便能卡住。
此前的火绳枪大多配发给了武装部长指挥的地方安保部队和杨家姐弟控制的游侠。只有很少一部分质量较好的被改造成了燧发枪，数量为三千根。这些火枪在李存真看来都是不合格产品。因为他们属性各异很可能破坏操典，使新兵训练和日后战斗时使用技术存在巨大差异。
火枪看起来容易，其实制造起来非常困难，特别是对于十七世纪的科技水平来说，其中的每一个部件背后都是一座工业和技术的大山。别的不说，光是枪管，为了克服热胀冷缩就让人类花费了两百年。
而现在是十七世纪，在江南地区昼夜温差不大且四季温差较北方更小的情况下，使用线膛枪兴许还勉强凑合，若是在辽东地区，特别是冰天雪地的情况之下，火药燃烧产生的热量对于枪管粗细的细微变化的影响，将会极大地影响射程和精准度。只能使用滑膛枪，而且因为冷热不同，滑膛枪威力也会受影响。
不过，现在还不是考虑辽东地区的时候。新东江镇保持现在的态势，本身就是对满清的巨大威胁。
到了永历十五年三月，保罗督造的火炮取得了巨大成功，已经成功百门。其他火炮都已经开始铸造，舰炮数量预计到永历十七年时将足以装备十二艘荷兰式战舰，也就是一千一百门。
其实，对于南明来说，铸炮本身并不困难，困难的是铸造铁炮的原料。铜是铸造大炮的好材料，可是，铜本身也是铸造铜钱的主要原料，这之间存在巨大的张力。但是，想要让火炮结实耐用又非得用铜不可。所以，李存真专门从为铸炮开了铜矿。两年后成炮的这一批一千一百门火炮主要都是青铜炮。
这一千一百门火炮中，共有巨型火炮二十四门，按照英国火炮分类标准，这二十四门火炮为“特大型长炮”，一门炮的炮重就超过七千镑，能够打三十二镑的炮弹，口径为六点二英寸，炮长十六英尺，有效射程能够达到两千码，最大射程七千码。
保罗没有制造更大的火炮，不是不会，而是希望在制造和使用特大型长炮的过程中更多地积累经验，然后再造更大的更为成熟的舰载火炮。