双方都是“麻秆打狼”，不想把事态扩大。马麟积极出面和解，先派厅长魏敷滋、局长马昆山到兰调停，表示请先恢复马鸿宾之自由，马决不向雷寻衅，他和马步芳“均可以身家担保”。后又亲自到新城，提出马鸿宾辞去甘肃省政府主席职务，率其第七师回宁夏的方案，向南京政府发电，未得到答复。11月吴佩孚到兰州，才将此事和解。但野心勃勃的吴佩孚当了一次解人，即认为自己余威尚在，命其处长刘泗英等运动奔走，策划东山再起。遂以马麟领衔，联合甘、青、宁、新、川五省将领的名义，发出通电云：
日本强权侵略，为我世仇。甲午以还，得寸进尺，割地剥利，攫夺无厌。近益恣其凶残，占我东北，横施压迫，逞所欲为，势将亡我国家，灭我民族。凡属国民，亟宜坚其汉满蒙回藏五族共和之心，合我四百兆同胞相扶相助之力，立捐私怨，共秉公忠，团结精神，一致对外。今幸宁粤各方，共谋统一，荩筹国是，自有良猷。惟是敌忾同仇，端资袍泽。窃以吴上将军子玉，为国元老，韬晦蜀右，于兹数载，身虽寄乎山水，心常系于国家。际此外患危急之秋，翩然莅陇，谢安未老，共仰东山。矧其前戍辽东，适逢日俄战役，满洲形势，日本军情，观察靡遗，了如指掌。应请中央及全国袍泽民众，一致敦请出山，主持对外军事，为政府外交之后盾，作人民救国之先锋。麟等志切为国，愿赴疆场，马革裹尸，虽死犹烈。国将不国，敢有他心，迫切陈词，诸维亮察。青海省政府代主席兼甘肃骑兵第一师师长马麟、新疆省政府主席兼边防督办金树仁、宁夏省政府主席兼第七师师长马鸿宾、川陕边防督办刘存厚、第二十八军军长邓锡侯、第二十九军军长田颂尧、第二十军军长杨森、川甘边区剿匪总指挥黄隐、甘肃全省保安总司令雷中田、甘肃省政府代理主席马文车、第八师师长潘振云、第九师师长马步芳、第十三师师长陈珪璋、第十四师师长鲁大昌、甘肃陇南绥靖指挥马廷贤、甘肃第三师师长王家曾、甘肃第四师师长高振邦、独立第十旅旅长李贵清等叩咸印
此电一发，自然使各方震动；时吴自称“兴总司令”。蒋介石岂能将他容得！急电潼关行营主任杨虎城，监视吴之行动，杨即以行营参谋长兼第十七师师长孙蔚如进兵兰州，驱吴赴北平。马麟见事态扩大，不敢开罪于蒋介石。同月21日，径电蒋自解：“该项通电，纯系甘作驱策之一、二小军阀捏造……事前事后，此间未与闻。”12月1日，再电蒋介石、杨虎城，声明“并未预闻其事”。还给马文车写信说：“……惟中央之命是从，蒋公以知遇视我，当以知遇报之，未敢见异思迁，中途再醮。”如此反复申辩，终难推脱干净，真是跳进黄河洗不清。此事办得甚为拙劣！
四、继兄主青
1931年8月5日，马麒病逝。省主席宝座谁属，在马步芳以为，父死子继，理所当然。但青海的老年派恐马步芳上台遭受排挤，遂以马步芳不是省政府委员、按例不得任省主席的理由，提出由省政府委员兼建设厅长马麟继任。马步芳既然一时弄不到手，以“先人创立的基业，岂能拱手让人”，亦不得已而求其次，勉强同意。于是电请中央任命。1931年9月2日，南京政府任命马麟为青海省政府主席，任马步芳为省政府委员。但马步芳心有未甘，怨恨老年派之情溢于言表，如黎丹的秘书朱炳，时任西宁县长，马步芳派其传令兵蹲在县府，日夜逼催军费，朱炳无法应付，由黎丹引见马步芳，朱跪求缓期，始得稍加宽容。又民政厅长王玉堂的科员王省三，因书信中有马步芳毒害人民的话，即遭到暗杀。
马麟主持省政，既缺乏眼光，又无魄力无办法，而且有个爱财如命的致命弱点，不顾大局如何，只是自己弄钱。加上有个野心勃勃的侄子马步芳觊觎他的宝座，时时事事设置障碍，予以掣肘，马麟破格拟任北大毕业学生冯国瑞为秘书长，省政府会议他自己多不参加，以冯代之，倚为左右手。马步芳即借冯国瑞之弟贪污公款案，对冯施加压力，冯被逼无奈，只好离开青海。马麟无得力人物辅佐，遂使局面日趋艰难。最棘手的是财政问题。当时青海全省年收入约银币300万元，开支中军费约占80％，行政费及其他临时费仅占20％。马步芳时为新编第九师师长，所征之款，多直接交给马步芳。马麟所得者，只有海北地区开采金矿的课金，远不敷用，遂决定印发纸币200万元，令财政厅长魏敷滋负责办理。接着成立青海省金库，发行“青海省金库维持券”，券额为一角、一元、五元、十元四种，第一次发行60万元，第二次为150万元，第三次为200万元。又以当二百文的大铜圆作为辅币。如此大量发行纸币，使货币日益贬值。大铜圆起初面值为二百枚，而兰州大铜圆面值则较低，商人大量贩入，充斥市面。马麟令加砸“TS”字母，作为限制在青海省内流通的标记。这时大铜圆总额已达30万枚，马麟即借此将这些货币中饱私囊。而马步芳则极力扩充军队，购买枪支，军费逐年增加，以致财政日益支绌。呈请中央政府接济，并派省政府秘书长谭克敏前往南京见军政部长何应钦，经何周旋，每月准拨发行政费20万元。但马麟却将10个月的行政费暗运其临夏癿藏私宅。因此，人们当时把癿藏称之为“白藏”。
1934年上半年，有“四马”驱孙的宁夏之战，前已交代。此事对马麟、马步芳震动很大，因为孙殿英西来，即是向他们争夺地盘，岂能容得？所以马麟首先指使青海各民众团体，蒙、藏王公，活佛发表反对孙殿英入青的谈话，并派祁中道、马绍武和敏珠尔活佛到南京向行政院请愿，又赴江西面见蒋介石，以“供应困难，地方不胜负担”为由，反对孙部入青。之后，即令马步芳、马步青率部到宁夏，参加拒孙之战。战争结束，马步芳率部返回青海后，乘战胜之机，利用谭克敏向何应钦、吴济川向杨虎城、郭学礼向陈立夫、谢杰刚向朱绍良分头活动，将其新九师改编为正规军陆军第一百师，接着又扩编为新编第二军，下辖第一百师和两个独立骑兵旅（马鸿逵则自称是由他保荐，马步芳才得当上军长）。1935年6月18日，军委会任马步芳为青海保安处处长。马步芳乘机成立省保甲厉行委员会，组织保甲训练壮丁。划全省为15个区、107个团、434个营（队），共计官佐兵夫15万多人。各种武器139900余件，内步枪51800余支、马枪633支、手枪129支，其他为刀矛之属。并设立省保安军官教育团，轮训官佐。马步芳的羽毛丰满了。
马步芳军队的扩大，更增加了军费的开支，使青海财政无法维持。加上马麟贪得无厌地中饱私囊，遂使公务人员大吃苦头。各机关每月只发办公费，职员有改业者，有私营商业者，年老乏力的，只好“嗷嗷待哺”。后来转而折扣公教人员薪金，先以7折扣发，后又以双七折扣发。最后除财政厅、军事处两单位外，所有机关、学校的经费全部停发，时达1年又9个月之久。后马麟又出“高招”，以“青海省金库维持券”贬值，于1934年6月改发“青海省临时维持券”，券面为一元、五元、十元三种，发行总额第一次公布为80万元，实际不止此数。马步芳不甘于马麟暴利独占，派人在周家泉花园大批仿制，骗取省政府和财政厅印信，如式加盖后，一面用以向商会套购大批物资，一面由军部军需处用以发放军饷。1935年4月，马麟又第二次发行100万元。这样，两人所制维持券大量充斥，导致通货膨胀，物价飞腾，金融混乱不堪。马麟事出无奈，于同年10月7日，命令青海省平市官钱局兑现，起初以维持券一元兑换银元两角，后来减至一角。即使如此，前来兑现者仍是拥挤不堪。又在财政厅、一百师师部及西宁县商会等处分别设点兑现，并出动军警弹压，打伤挤伤100余人，1人被打死。5天之内，兑换维持券130多万元，换出银元18万多元。又不过四五天，借口发现假券，停止兑现，维持券成为废纸，群众大哗。马步芳乘机煽风点火，支持一些人将平市官钱局捣毁，一些老弱妇孺把省券带到城隍庙痛哭焚化。一些商号则以拒收省券而关门，西宁市面一片萧条景象。适马麟将积年搜刮的黄金、白银，伪称青盐，由西宁向癿藏运送。马步芳觇知，派人在大峡抢劫一空，又勾结马麟家人，多次窃取马麟的珍贵财物。马麟经商外运的皮货，马步芳亦派人强行征税。马步芳还暗地鼓动群众，在马麟由东关私邸赴省政府途中，拦阻哭泣，要求省钞兑现，给马麟以难堪和被动。形势如此，马麟已无法维持，遂于1936年8月，电请国民党中央，因病休假6个月，不料事为马步芳侦悉，马步芳密令译电员在此电文末尾加“政务由马步芳代理”一语，蒋介石复电照准。马麟见复电莫名其妙，不知所措，只好先回癿藏家中。马步芳遂于同月13日代主省政。
马麟在癿藏抑郁难忍，谭克敏建议赴上海就医，遂于8月份偕谭赴兰州，向绥靖主任朱绍良诉苦。朱对两马龃龉，未置可否。马麟在上海，住朱绍良私邸，上海市长吴铁城、淞沪警备司令杨虎前来解劝。马稍舒隐痛，嘱令谭克敏向报界发表谈话云：“马主席年事已高，素患痛痈。盖因积年治军，奔走各处，生活不定，精神受刺激所致，时愈时发。最近请假六月，曾先赴乡静养，兹为求根本治愈起见，特来沪就医，同时需进京晋谒林主席、蒋院长，报告省政，并有所请示。再定期北返。惟马主席因属回教，或可便道赴汉志一行。”10月12日马麟飞南京见蒋，控告马步芳，要求护持。蒋乐得其叔侄矛盾，便中利用，未正面答复。只同意马赴麦加朝觐，再续给假5个月，并给旅费1万元。马麟遂于同月27日在沪乘阿飞隆号轮船怏怏出国。
五、玉树阻击
1932年，在玉树地区，发生了一次青藏战争。
自西姆拉会议之后，西藏问题迄未得到解决，英帝时时在虎视眈眈。1930年“九一八”事变和次年的淞沪抗日战争的发生，英帝以有机可乘，又唆使西藏亲英势力，再次挑起事端，策动西藏军队约2万人分兵三路向内地进犯。南路由代本西哇冷巴指挥，进犯巴塘一带，中路由代本穹让指挥，进犯甘孜、德格一带，北路由代本厦苏指挥，进犯玉树一带。主攻方向为西康西区。西康省政府主席刘文辉所部扼金沙江固守，藏军不得前进。藏军又借口“尕旦寺事件”，重点转向玉树进攻。原来玉树苏尔莽族地区有一个黄教的尕旦寺，属于西藏派堪布管理；另一个白教的德赛寺，为青海玉防司令所支持。两寺每年秋天都要抢收附近藏民的庄稼，双方发生矛盾，尕旦寺向西藏方面求助，遂成为藏军进犯的口实。先由原驻昌都的北路总管三王千布率部4000人至青边，大军继进。时青海方面，马步芳继马麟之后任海南警备司令，兵力有马彪的步兵第三旅和马训的骑兵第一旅，分8处屯驻防守。1930年底藏军入界后，马步芳以兵力不足，暂避其锋，令马彪部撤出大小苏尔莽，并令军民欢迎藏兵入境。马彪又派秘书王家楣及千百户代表与藏方和谈，形势暂趋缓和。1932年2月间，藏军增加到五六千人，并断绝交通，拆毁桥梁，向囊谦、拉秀等地进攻。3月24日，藏军炮击大苏尔莽，青海守军仅40余人，坚守八昼夜，最后撤出，苏尔莽遂被藏军占领。
青海军退守结古待援，藏兵一面包围结古，一面分兵渡通天河而北，占领北岸之斜武、拉布等地，截断了结古青海军的后路；抢走通天河渡船，断绝玉树与外界的联系。马麟急派马训为玉树宣抚使，于同年5月率骑二团马忠义部从西宁出发，6月18日抵玉树，先派人持马麟、马步芳署名的函件与藏军首领脑坎群达哇洽商和平解决，遭到藏方的拒绝。于是，双方于6月27日交战，死伤各200余人，7月23日战于通天河，藏军后退。后来，青海方面喇平福团和马禄旅继续增援，与藏军再战于结古，藏军见青海军势盛，先退出巴塘滩，继又退出拉秀寺，结古之围解除。8月20日之后，青海军乘胜追击，次第收复小苏尔莽和大苏尔莽。10月初，藏军全线溃退，青海军进逼昌都，与四川刘文辉部联合进攻昌都。