洪宪垮台，护国成功，梁启超和蔡锷这师生二人成为当时众望所归之人。
黎元洪极渴望能获得护国军方面更多的支持。有人向黎建议，礼聘梁启超为总统府秘书长，这正和黎元洪意。
七月一日黎元洪致电梁启超：“屡承来训，虑远思深，谋国之心，家居弥笃。泰山北斗，景仰为劳。亦每知读礼之时，不敢以阁员相浼，然万端待理，棼如乱丝，辱以庸才，丁兹危局，设使旧鼎覆餗，沦胥以灭，既负人民望治之心，亦违先生救时之愿，窃不自揣，欲以本府秘书长相屈，既无嫌乎夺情，且可资乎论道。先生模楷人伦，万流仰镜，倘肯垂念邦国，当不忍金玉尔音。敢布寸心，拥彗俟命。”
梁启超是何等聪明之人。又何尝不知道这是吃力不讨好的差事，所以婉言谢辞。
黎元洪自是不肯放弃，随后多次致书遣人邀梁入京，“赞襄一切”，并命公府收支处自七月份起月赠津贴二千元。
其中有一致梁函写道：“自违尘教，裘葛载更。岭树江云，迢迢千里，虽鳞鸿多便，邮电常通，而仰企之怀，未足罄其万一也。徐君佛苏到京，询悉素履安和，旅祺清适，欣慰不可言喻。国家多故，祸变相寻，赖执事奔走提倡之功，与夫调护斡旋之力，幸得由剥而复，转危为安。元洪不才，亦获随诸君子后，共荷钜艰，凡百措施，均资指导，嘉猷伟略，薄海同钦，此固民国无疆之休，非仅私幸已也！
“现在国会将开，人心粗定，而茫茫前途，来日大难，一切建设问题，非得宏才卓识如执事者，从容坐论，随事谘商，长夜冥行，其何能淑？前曾奉上一电，敬迓高轩，适执事俨然在忧服之中，哀毁已甚，未便固请，然引伫足音，寸阴若岁，自夏徂秋，虚席以待者，亦既三阅月矣！屈指读礼之期，行满百日，为国夺情，万民所望，睹此危局，宁忍恝然。伏乞台从北来，克日命驾，慰我饥渴，示我周行，九顿以请，幸毋遐弃，鉴此微忱。”
足见黎元洪是心诚至极、求贤若渴；但梁启超还是不为所动。
民国五年双十节，黎元洪以共和重建为名，发表了一大批授勋令。
首授孙中山大勋位；蔡锷、唐继尧、陆荣廷、梁启超、黄兴、岑春煊六人以勋一位；段祺瑞、王士珍、冯国璋三人以一等大绶宝光嘉禾章。
勋章颁赠得很多，可谓阳光普照。既有西南护国起义的诸多将领，又有北洋派所有拥有兵权者，甚至逊清皇室之世续、载涛、绍英等也都榜上有名。有鱼龙混杂和勋章如雨之嫌，但是，中山先生和护国元勋获得高勋位，毕竟意义重大。
段祺瑞的国务院关于上层和地方的人事安排，也陆续出台：
六月十三日令徐树铮为国务院秘书长，令王式通为国务院参议。
三十日政.府人事大改组，批准原外交总长、交通总长曹汝霖，内务总长王揖唐、海军总长刘冠雄、司法总长、农商总长章宗祥、教育总长张国淦辞职。
同时任命唐绍仪为外交总长、许世英为内务总长、陈锦.涛为财政总长、程璧光为海军总长、张耀曾为司法总长、孙洪伊为教育总长、张国淦为农商总长、汪大燮为交通总长、段祺瑞自兼陆军总长。
唐绍仪未到任以前陈锦.涛暂兼外交总长，张耀曾未到任前，以张国淦兼司法总长。
七月十二日再局部改组，以孙洪伊为内务总长、范源濂为教育总长、许世英为交通总长。八月一日改派谷钟秀为农商总长，张国淦任总统府秘书长。
七月六日，决定对于各省军政首长的名称加以修改，在官制未定以前，各省督理军务长官改称督军，民政长官改称省长。
陆续任命张作霖为奉天督军，孟恩远吉林督军，张怀芝山东督军，赵倜河南督军，阎锡山山西督军，冯国璋江苏督军，张勋安徽督军，李纯江西督军，李厚基福建督军，吕公望浙江督军，王占元湖北督军，陈宦湖南督军，陈树藩陕西督军，蔡锷四川督军，陆荣廷广东督军，陈炳焜广西督军，唐继尧云南督军，刘显世贵州督军。
朱家宝为直隶省长，郭宗熙吉林省长，毕桂芳黑龙江省长，田文烈河南省长，沈铭昌山西省长，齐耀琳江苏省长，倪嗣冲安徽省长，戚扬江西省长，范守佑湖北省长，张广建甘肃省长，杨增新新疆省长，朱庆澜广东省长，罗佩金广西省长，任可澄云南省长，戴戡贵州省长，胡瑞霖署福建省长，孙发绪署山东省长，张作霖兼署奉天省长，吕公望兼署浙江省长，陈宦兼署湖南省长，陈树藩兼署陕西省长，蔡锷兼署四川省长。
朱家宝兼署直隶督军，毕桂芳兼署黑龙江督军，张广建兼署甘肃督军，杨增新兼署新疆督军。
湖南督军陈宦未到任前以陆荣廷暂署，广东督军陆荣廷未到任前以龙济光暂署。令汤芗铭为广东查办使，李烈钧为陆军中将加上将衔。
上层和各省军政首长名单，是煞费若心的。一方面要促进南北统一，兼顾方方面面，特别是北洋系和护国军方面。另一方面也面对实际。
这次人事安排，无论帝制与反袁派，在位和不在位的，都给予一定的位置，在安排上算是尽了最大努力。
这应该是总统府与国务院方面协商和妥协的结果。
从黎元洪方面要倾向护国军一些，而段祺瑞则要努力巩固北洋势力。但是，肯定地说，主导意见是来自段祺瑞。
新政.府本意想在各省实现军民分治，所以只有少数省份是以督军而兼署省长的，署是临时性质。
四川、湖南、广东、广西这四个省人事是老大难。新政.府不管动机如何，如此安排不但不能平衡各方面矛盾，简直是播下了战争种子，成了制造了纷乱的根源，尤其是对湖南。
为什么不维持汤芗铭的湖南督军而改派使他为广东查办呢？原来就在发表各省督军名单的前两天，湖南出了事。
湖南宣布护国独立时，北洋军第六师在湘西，安武军倪毓棻部在岳州。汤芗铭能指挥的，只有北洋军一个混成旅。由旅长车震率领，驻扎在长沙附近。
这时候，广西军已有一部分到达衡阳和宝庆。陆荣廷以护国军湘、粤、桂联军总司令身份，于六月初由广东开到湖南，进驻衡州。
在湖南内部，赵恒惕等已组成了湘军两师，湘西一部分民军也开到长沙附近成立了一个师。这是个剑拔弩张的局面，北洋军与护国军无法和平相处，随时可能发生冲突。
汤芗铭的处境和陈宦在成都差不多，既不能指挥驻扎在湘西、湘北的北洋军，又不能指挥湖南的民军和桂、粤的客军。
最糟的是湖南人恨透了这个杀人如麻的汤屠户，各路民军要围攻长沙，以及国民党人要用手枪和炸.弹对付汤的风声传遍了长沙城。七月四日深夜，汤芗铭在惶惶不可终日中离开了长沙。
汤芗铭走后，湘军已成立了三个师，师长是陈复初、赵恒惕、陈忠洵。曾继梧以湘军第一军长暂代湖南都督，龙璋暂代湖南民政长。随后程潜以湖南护国军总司令名义由云南到了湖南，他的部队改为湘军第四师。
汤芗铭的离去，并未减轻湖南的矛盾和冲突，而七月六日北京政.府又发表陈宦为湖南督军兼署省长，陈宦未到任前，派陆荣廷署理督军和省长，这个命令使湖南更加复杂了。
在段祺瑞看来，无论袁世凯有千错万错，陈宦都不应该做出与袁绝交的事，太不够意思了。天下人都可这样做，唯有你陈宦不行。或许段祺瑞对陈宦原来就没有好印象，现在则恶劣至极。那么段又为什么同意派陈为湖南督军兼署省长呢？这是由于黎元洪坚决主张必须给陈一个督军职务。
当汤芗铭逃离湖南后，段打算迅速派遣一支北洋军进驻湖南，又苦于无兵可调。恰好这时陈宦由四川撤出时，手上还有两旅兵力，派他就近入湘，既可敷衍黎，也算是给陈一个落脚之地。
这道命令立刻引起了湖南人民的激烈反对。湖南人好容易赶走了一个北洋军阀，怎能接受再来一个北洋军阀。为抵制北京政.府的任命，湖南各界推举年已七旬的刘人熙为湖南都督。为什么推刘呢？因为刘人熙以前做过广西藩台，与桂军陆荣廷颇有渊源，想通过刘的关系取得桂军协助抗拒北洋军。
陆荣廷支持湖南人民这个行动，因为桂军也不希望北洋军大举进驻湖南。北洋军入湘不但遭到湖南人民和滇军、桂军的抵制，其他党派人士如熊希龄、范源濂等也很反感，这些人很希望调蔡锷回到湖南，国民党人士则希望以由美返国的黄兴来担任湘督。可是蔡、黄两人均无意于此职。黄兴推荐谭延闿，谭在各方都有很好的人缘，只不过和北洋系的关系不够深。
这时候的陈宦可谓是四面楚歌。世界上的事有时是很不公平，窃国大盗袁世凯干了那么大的坏事，还能风风光光地的下葬，但陈宦这个上了袁世凯贼船的人，却不能被反袁派们所谅解。而袁系的人又因他的背叛而不待见他。
识时务的陈宦知道自己不合适干到湖南任职，主动表示辞去湘督。而段祺瑞也清楚，如果硬性派北洋军人入湘，必会引起战争。因此他于七月十六日改派刘人熙为湖南督军，并下令把第六师由湘西调回江西，第七师由四川调往洛阳，第三师也由四川调回岳州。
段祺瑞本来预定的计划是派第三师师长曹锟继陈宦以后的湖南督军，可是，段自己觉得他在北京的基础尚未稳定，必须有一个可靠的北洋大将在自己身边，以加强自己的地位，因此选中了曹锟。曹一直给人印象是“老实人”，所以段调曹为直系督军，同时把七月间开回岳州的第三师分批调回北方。
这并不等于段完全放弃湖南，因为他又安了一个棋子在湖南，即派他的内亲吴光新率领北军第三旅接防岳州。这当然是埋伏吴做为将来湘督的打算。正所谓天下事如要人莫知，除非已莫为。段内定吴为湘督的消息，立刻传遍了湖南，当然又引起湖南全省激烈的反对，甚至公开宣称为了抗阻北洋军，不惜一战。
段祺瑞总算领教了湖南的强硬，大概也知道了即便是他这样的大权在握，也不能为所欲为。于是在八月三日下令改派谭延闿为湖南省长兼署督军。
谭延闿是反袁的，他在湖南很得人望。癸丑二次革命失败后，他承当一切湖南的责任。袁世凯调他和赵恒惕赴京，赵被囚，他亦形同软禁，有这段经过，更使他在湖南受人爱戴。